Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm10666-201ENSMUST00000098722 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r114-201ENSMUST00000098737 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm10670-201ENSMUST00000098744 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r93-201ENSMUST00000098747 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Mannr-201ENSMUST00000193549 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 A830011K09Rik-202ENSMUST00000162868 2201 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Tbx22-201ENSMUST00000068451 2947 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Olfr125-202ENSMUST00000213857 3835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Olfr916-203ENSMUST00000214093 3685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Oog1-202ENSMUST00000222112 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Mir291a-201ENSMUST00000104815 82 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm13122-201ENSMUST00000118380 453 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm14253-201ENSMUST00000122112 639 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 8030453O22Rik-201ENSMUST00000128919 370 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm12195-201ENSMUST00000144990 469 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm23123-201ENSMUST00000157648 144 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm24727-201ENSMUST00000158231 144 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm7241-201ENSMUST00000159853 357 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm19807-201ENSMUST00000173971 667 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Mir3070b-201ENSMUST00000175205 89 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm27875-201ENSMUST00000184425 123 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm27445-201ENSMUST00000184484 72 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm27538-201ENSMUST00000185065 294 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm28179-203ENSMUST00000191382 544 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm8790-201ENSMUST00000194108 322 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm18100-201ENSMUST00000200897 452 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm20559-201ENSMUST00000201032 433 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm31532-201ENSMUST00000203555 767 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm8820-201ENSMUST00000204077 571 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 AC140210.1-201ENSMUST00000224961 534 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Olfr629-201ENSMUST00000051346 1122 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Olfr998-201ENSMUST00000052307 1012 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Olfr782-201ENSMUST00000077024 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Ube2nl-201ENSMUST00000085228 456 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm9911-201ENSMUST00000211467 2802 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 AC124562.2-201ENSMUST00000223888 2313 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Plek-202ENSMUST00000102881 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm14308-201ENSMUST00000108990 1628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Iigp1-201ENSMUST00000032473 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 AC164297.4-201ENSMUST00000224225 1307 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm43047-201ENSMUST00000200089 3460 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Mgat4c-202ENSMUST00000120748 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm29114-201ENSMUST00000187100 2508 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm8011-201ENSMUST00000172163 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm12845-201ENSMUST00000203629 1767 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm43751-201ENSMUST00000200275 3071 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Cfh-202ENSMUST00000111976 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Cfh-201ENSMUST00000066859 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Ifi213-201ENSMUST00000097462 2680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Trdv5-201ENSMUST00000103685 438 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm23133-201ENSMUST00000104255 135 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Cyp2j7-ps2-201ENSMUST00000119189 179 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm12515-201ENSMUST00000120116 361 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm26476-201ENSMUST00000122618 313 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm6058-201ENSMUST00000154261 399 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm22219-201ENSMUST00000157562 319 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm23554-201ENSMUST00000157818 110 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm22637-201ENSMUST00000158144 283 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Obox4-ps29-201ENSMUST00000175956 1134 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm27242-201ENSMUST00000184211 1151 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm27695-201ENSMUST00000184301 91 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm28304-201ENSMUST00000185977 312 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 2310030A07Rik-201ENSMUST00000186460 610 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm20268-201ENSMUST00000187932 845 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm29256-201ENSMUST00000189094 312 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm28484-201ENSMUST00000190606 312 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 4930590L20Rik-201ENSMUST00000193820 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm37209-201ENSMUST00000194109 1276 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm44354-201ENSMUST00000196017 143 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm7468-201ENSMUST00000203900 652 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm6842-201ENSMUST00000211361 390 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm34113-201ENSMUST00000213796 388 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 AC122210.1-201ENSMUST00000217923 675 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 AC100590.2-201ENSMUST00000219028 215 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm31931-201ENSMUST00000219666 222 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 AC160931.2-201ENSMUST00000221445 351 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 AC165437.1-201ENSMUST00000228640 536 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Olfr902-201ENSMUST00000050733 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm26121-201ENSMUST00000083364 162 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Dmd-203ENSMUST00000114000 14910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Stk31-202ENSMUST00000163954 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Zscan4f-202ENSMUST00000145237 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r52-205ENSMUST00000227893 3108 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1242-203ENSMUST00000143935 2406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r106-201ENSMUST00000167464 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm12568-201ENSMUST00000117362 624 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm4852-201ENSMUST00000121202 729 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm11403-201ENSMUST00000122195 369 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm14435-202ENSMUST00000127687 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm3848-202ENSMUST00000151564 301 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Mir1947-201ENSMUST00000158235 85 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm23023-201ENSMUST00000158767 109 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm5527-201ENSMUST00000179821 642 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Rprd1bQ9CSU0 Gm26556-201ENSMUST00000180645 320 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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