Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm8458-201ENSMUST00000196658 819 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Igkv12-40-201ENSMUST00000199208 347 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm2314-201ENSMUST00000200391 586 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 4930487D11Rik-201ENSMUST00000201983 295 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm45226-201ENSMUST00000206602 288 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm44857-201ENSMUST00000208331 196 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm7128-201ENSMUST00000211639 533 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm45710-201ENSMUST00000212847 215 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 AC155929.1-201ENSMUST00000220217 1276 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm46996-201ENSMUST00000220924 408 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm23975-201ENSMUST00000082685 106 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm24166-201ENSMUST00000082724 135 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm25410-201ENSMUST00000083758 137 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm25512-201ENSMUST00000083863 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Pign-201ENSMUST00000070699 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Agbl1-201ENSMUST00000026854 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Olfr560-201ENSMUST00000210453 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Olfr1501-202ENSMUST00000208493 4230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Vmn1r189-203ENSMUST00000228428 3231 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Olfr1484-203ENSMUST00000215567 3699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Cmah-202ENSMUST00000110391 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm5746-201ENSMUST00000183550 2200 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm45223-201ENSMUST00000207037 5138 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Olfr910-201ENSMUST00000215122 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Fgd4-206ENSMUST00000161861 8342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm42728-201ENSMUST00000202644 1552 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Usp9x-201ENSMUST00000089302 11887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Abca16-201ENSMUST00000056042 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Hnrnpr-207ENSMUST00000148843 21452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Traj2-201ENSMUST00000103738 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Trac-201ENSMUST00000103740 413 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Fam122c-201ENSMUST00000114835 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm15193-201ENSMUST00000120224 865 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm13867-201ENSMUST00000120844 395 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm15267-201ENSMUST00000120888 464 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm14408-202ENSMUST00000126726 279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm22601-201ENSMUST00000157595 250 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 4933433F19Rik-201ENSMUST00000180571 1088 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm26828-201ENSMUST00000180640 172 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm27964-201ENSMUST00000185195 62 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm28116-201ENSMUST00000189064 387 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm8939-201ENSMUST00000192577 964 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Rpl23a-ps5-201ENSMUST00000194566 466 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Ube2l3-ps1-201ENSMUST00000199777 436 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm43925-201ENSMUST00000203498 206 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm19096-201ENSMUST00000209705 766 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 AC131720.2-201ENSMUST00000220420 431 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm40884-201ENSMUST00000223505 541 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 AC158955.1-201ENSMUST00000227140 385 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Olfr904-201ENSMUST00000058153 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Olfr736-201ENSMUST00000058965 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Olfr611-201ENSMUST00000078108 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm23097-201ENSMUST00000083448 105 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Ncoa7-207ENSMUST00000215740 7043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Clvs1-202ENSMUST00000108348 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 AC133076.2-201ENSMUST00000227678 3532 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Olfr59-201ENSMUST00000143976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm42494-201ENSMUST00000196515 3051 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm11823-201ENSMUST00000130582 2278 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm33680-202ENSMUST00000219411 3401 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Olfr1387-202ENSMUST00000214541 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm42955-201ENSMUST00000197355 3393 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Btla-201ENSMUST00000063654 3235 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm15128-202ENSMUST00000178833 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Olfr1104-203ENSMUST00000215972 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm43188-201ENSMUST00000200180 2160 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm14909-201ENSMUST00000117853 351 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm25667-201ENSMUST00000157701 275 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Gm17421-201ENSMUST00000167845 674 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ChfrQ810L3 Mir1957b-201ENSMUST00000184608 123 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms