Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Naalad2-207ENSMUST00000172171 4066 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Igkv1-133-201ENSMUST00000103304 374 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Gm14669-201ENSMUST00000118841 250 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Gm3531-201ENSMUST00000162698 489 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Arpp19-211ENSMUST00000170310 899 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Gm20830-201ENSMUST00000178016 684 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Gm20812-201ENSMUST00000179220 684 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Obox4-ps39-201ENSMUST00000184306 628 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Gm27148-201ENSMUST00000185086 160 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Gm18505-201ENSMUST00000187360 790 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Gm43043-201ENSMUST00000196579 412 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 7330423F06Rik-201ENSMUST00000197499 301 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Gm44679-201ENSMUST00000207202 2908 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Gm44927-201ENSMUST00000207573 716 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 AC132384.5-201ENSMUST00000218562 226 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 AC158641.1-201ENSMUST00000218933 229 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 4930555G07Rik-202ENSMUST00000219879 750 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 AC115289.1-201ENSMUST00000224915 522 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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Usp48Q3V0C5 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Gm44668-201ENSMUST00000207911 3265 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Olfr1031-202ENSMUST00000216807 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Vmn1r35-204ENSMUST00000227749 2254 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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Usp48Q3V0C5 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Nxt2-202ENSMUST00000112913 2538 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Gm19035-201ENSMUST00000193299 1742 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 4930444P10Rik-201ENSMUST00000115367 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Gm14046-201ENSMUST00000119389 509 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
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Usp48Q3V0C5 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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Usp48Q3V0C5 Gm8708-201ENSMUST00000188500 906 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Gm37743-201ENSMUST00000194645 376 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
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Usp48Q3V0C5 Gm44472-201ENSMUST00000204922 943 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 1700061N14Rik-201ENSMUST00000212295 463 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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Usp48Q3V0C5 Olfr825-201ENSMUST00000076814 1159 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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Usp48Q3V0C5 Snora30-201ENSMUST00000083325 130 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Olfr203-201ENSMUST00000089305 924 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Gm7195-201ENSMUST00000190869 1707 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Gm24350-201ENSMUST00000104163 133 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Gm13082-201ENSMUST00000118877 561 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Gm14852-201ENSMUST00000120065 647 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Gm13973-201ENSMUST00000121371 894 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Gm11861-201ENSMUST00000141571 382 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Gm15521-201ENSMUST00000141752 835 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Gm27028-201ENSMUST00000182303 399 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Gm28615-201ENSMUST00000187527 482 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Sprr2g-202ENSMUST00000189634 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Gm2077-201ENSMUST00000195017 319 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 4930595L18Rik-201ENSMUST00000204069 506 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Gm7706-202ENSMUST00000211278 590 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 Jakmip1-216ENSMUST00000212997 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Usp48Q3V0C5 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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