Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Igkv13-57-2-201ENSMUST00000196590 336 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm43853-201ENSMUST00000197162 301 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm43855-201ENSMUST00000197462 507 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm44376-201ENSMUST00000197570 128 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Obox4-ps24-201ENSMUST00000197686 540 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm42500-201ENSMUST00000199898 517 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm44282-201ENSMUST00000203199 190 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm45006-201ENSMUST00000206078 690 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm4528-201ENSMUST00000207905 551 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Olfr496-ps1-201ENSMUST00000208862 915 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm18729-201ENSMUST00000217230 621 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm29884-201ENSMUST00000218403 453 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Vmn1r89-206ENSMUST00000227319 985 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Dynap-201ENSMUST00000025390 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Reg3g-201ENSMUST00000032089 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 n-R5s151-201ENSMUST00000083959 119 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm26717-201ENSMUST00000181713 1418 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 1700097M23Rik-201ENSMUST00000204079 1522 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Olfr1298-202ENSMUST00000208284 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Olfr406-203ENSMUST00000217016 2651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Olfr102-202ENSMUST00000217590 2783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm26869-201ENSMUST00000181241 3523 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Olfr128-202ENSMUST00000216440 3644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm20139-202ENSMUST00000216041 3888 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Svet1-201ENSMUST00000209370 3940 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Zfp101-204ENSMUST00000174512 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm43705-201ENSMUST00000195958 3717 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Olfr782-202ENSMUST00000213970 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm43844-201ENSMUST00000202926 5605 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Olfr183-202ENSMUST00000206303 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Olfr1174-ps-201ENSMUST00000213348 1738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 AC164297.6-201ENSMUST00000224643 1568 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm36529-201ENSMUST00000222495 1529 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Fam205c-202ENSMUST00000107978 1451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm43178-201ENSMUST00000197257 1386 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Igkv5-45-201ENSMUST00000103366 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm25420-201ENSMUST00000104216 127 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm24792-201ENSMUST00000104286 128 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Acbd7-201ENSMUST00000115089 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm14007-201ENSMUST00000118288 210 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm13087-201ENSMUST00000118298 256 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm13785-201ENSMUST00000119099 690 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm13902-201ENSMUST00000120168 605 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps100-201ENSMUST00000120610 867 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm2182-201ENSMUST00000145243 663 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm23317-201ENSMUST00000157999 129 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm2930-201ENSMUST00000170403 474 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm17631-201ENSMUST00000171980 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps65-201ENSMUST00000174235 951 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm27817-201ENSMUST00000184302 233 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm29459-201ENSMUST00000191359 518 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm37164-201ENSMUST00000192809 637 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Pgk1-ps3-201ENSMUST00000198338 1201 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm32780-201ENSMUST00000201402 540 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Olfr747-202ENSMUST00000205373 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Klk1b18-ps-201ENSMUST00000205780 167 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm39231-201ENSMUST00000209813 501 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 AC154552.4-201ENSMUST00000222171 151 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 AL662807.1-201ENSMUST00000224183 126 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 AC154270.1-201ENSMUST00000227226 426 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Olfr186-201ENSMUST00000062380 1005 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm5518-201ENSMUST00000084171 648 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Olfr705-202ENSMUST00000213721 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 A530099J19Rik-201ENSMUST00000151029 2764 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Pde1a-205ENSMUST00000102654 4122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Adam26a-201ENSMUST00000049577 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Hdx-201ENSMUST00000038472 9385 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Olfr69-201ENSMUST00000106878 2829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 D130004A15Rik-201ENSMUST00000201492 1577 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Fbxw28-201ENSMUST00000112039 1497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm13310-201ENSMUST00000120962 1381 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Trav8n-2-201ENSMUST00000103632 408 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm23322-201ENSMUST00000104464 167 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Tfpi-205ENSMUST00000111717 2962 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm15916-201ENSMUST00000118355 736 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm13865-201ENSMUST00000120957 865 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm16412-201ENSMUST00000121602 273 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm22345-201ENSMUST00000122644 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm25106-201ENSMUST00000122672 134 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 2310016D23Rik-201ENSMUST00000130082 388 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 4930406D18Rik-202ENSMUST00000152827 657 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm25058-201ENSMUST00000157365 128 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm10177-202ENSMUST00000161698 207 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm14419-204ENSMUST00000178182 192 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm2004-202ENSMUST00000178872 192 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm14295-203ENSMUST00000179435 192 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
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