Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Stk31-202ENSMUST00000163954 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 5330434G04Rik-203ENSMUST00000142109 3449 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Rbm31y-201ENSMUST00000179408 1955 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm21379-201ENSMUST00000179772 1955 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm44846-201ENSMUST00000207127 3243 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr1216-202ENSMUST00000216000 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr267-202ENSMUST00000216719 4050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm28465-202ENSMUST00000220779 1701 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm37868-201ENSMUST00000195578 2735 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr393-201ENSMUST00000102523 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm15151-201ENSMUST00000117106 177 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm11393-201ENSMUST00000118019 288 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm11625-201ENSMUST00000119535 296 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm15885-201ENSMUST00000122114 388 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm11403-201ENSMUST00000122195 369 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm25438-201ENSMUST00000158281 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm24666-201ENSMUST00000158937 167 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Vmn2r-ps75-201ENSMUST00000173251 213 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Mir1251-201ENSMUST00000175486 84 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm26746-201ENSMUST00000181722 487 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Mir6963-201ENSMUST00000183535 71 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm28619-201ENSMUST00000185889 622 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm29193-201ENSMUST00000187129 830 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 AV026068-206ENSMUST00000187461 513 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm29053-201ENSMUST00000187484 370 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Mrgprb1-202ENSMUST00000188095 472 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm28994-201ENSMUST00000188556 621 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm28191-201ENSMUST00000189112 211 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm28954-201ENSMUST00000190031 437 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Scgb2b5-ps-201ENSMUST00000190227 270 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Ikzf2-209ENSMUST00000191262 1146 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm38363-202ENSMUST00000195029 622 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm31942-202ENSMUST00000195375 437 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm45063-201ENSMUST00000203726 472 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm44475-201ENSMUST00000204041 424 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm45029-201ENSMUST00000208702 391 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 AC153975.1-201ENSMUST00000220087 926 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 AC134537.3-201ENSMUST00000220154 503 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Cdrt4-201ENSMUST00000035854 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr479-201ENSMUST00000063151 1111 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr198-201ENSMUST00000064452 1054 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 1110015O18Rik-202ENSMUST00000183944 1533 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 AC149294.7-201ENSMUST00000227475 1432 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm14325-201ENSMUST00000108939 1576 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Zfp600-204ENSMUST00000168483 4244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm14308-203ENSMUST00000119149 1458 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm14434-202ENSMUST00000120959 1458 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr1222-202ENSMUST00000214027 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Pcdh11x-206ENSMUST00000192677 9097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr1030-201ENSMUST00000056849 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Vmn2r67-201ENSMUST00000168730 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Igkv9-124-201ENSMUST00000103312 287 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm23948-201ENSMUST00000104030 132 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm24855-201ENSMUST00000104848 97 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 S100a5-202ENSMUST00000107329 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm11874-201ENSMUST00000117437 130 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm15019-201ENSMUST00000120148 434 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm11982-201ENSMUST00000121480 314 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 4930421P07Rik-201ENSMUST00000147322 399 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 4930548K13Rik-201ENSMUST00000154459 561 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm12971-201ENSMUST00000154720 511 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm24059-201ENSMUST00000157493 312 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm18354-201ENSMUST00000173515 1068 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm23365-201ENSMUST00000175019 125 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm25960-201ENSMUST00000175110 125 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm44453-201ENSMUST00000175161 126 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm25195-201ENSMUST00000177656 126 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm21045-201ENSMUST00000183058 1020 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm27834-201ENSMUST00000183427 125 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Mir7676-1-201ENSMUST00000183491 62 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Mir7676-2-201ENSMUST00000183523 62 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Mir6393-201ENSMUST00000183709 94 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Mir3473f-201ENSMUST00000183743 136 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Mir7074-201ENSMUST00000183884 63 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm28030-201ENSMUST00000184987 138 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm3259-205ENSMUST00000185432 1077 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Rpl23a-ps8-201ENSMUST00000186144 463 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm29633-204ENSMUST00000187737 675 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 2810025M15Rik-203ENSMUST00000189791 251 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Rhoay-ps1-201ENSMUST00000191243 581 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm38201-201ENSMUST00000192143 387 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm37343-201ENSMUST00000192542 111 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm37698-201ENSMUST00000192605 463 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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