Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 4930583I09Rik-201ENSMUST00000024896 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Tas2r106-201ENSMUST00000076756 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Olfr727-201ENSMUST00000079142 1035 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Olfr507-201ENSMUST00000080014 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Mir202-201ENSMUST00000083568 72 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Olfr197-202ENSMUST00000207772 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 9430018G01Rik-201ENSMUST00000203260 3758 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm26760-201ENSMUST00000181901 1604 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Klri2-201ENSMUST00000050385 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 4921515E04Rik-202ENSMUST00000226383 1738 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm18913-201ENSMUST00000204311 1789 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Olfr1314-202ENSMUST00000207976 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Olfr32-205ENSMUST00000215659 2998 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Cntn6-201ENSMUST00000089215 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Olfr1316-202ENSMUST00000213696 4184 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm37868-201ENSMUST00000195578 2735 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Cp-205ENSMUST00000108329 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 AC140397.1-201ENSMUST00000225563 4562 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Olfr642-202ENSMUST00000214299 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Olfr711-201ENSMUST00000051715 3035 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Olfr109-203ENSMUST00000214938 5550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Ctps2-203ENSMUST00000112300 741 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm15087-201ENSMUST00000117465 1172 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm13603-201ENSMUST00000119404 83 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm13213-201ENSMUST00000119668 474 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm12873-201ENSMUST00000119988 422 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm9003-201ENSMUST00000121810 482 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm12998-201ENSMUST00000122445 789 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 2210408F21Rik-202ENSMUST00000124811 384 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm12854-201ENSMUST00000128518 297 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm15555-201ENSMUST00000128832 713 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm23465-201ENSMUST00000157134 262 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Vmn1r-ps29-201ENSMUST00000174862 785 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm7094-201ENSMUST00000178379 366 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Pnrc2-203ENSMUST00000180300 171 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 4930519F16Rik-206ENSMUST00000183292 800 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm27235-201ENSMUST00000184431 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm29563-201ENSMUST00000187249 496 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Scgb2b29-ps-201ENSMUST00000187539 331 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms