Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Gm14742-201ENSMUST00000148284 381 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Gm22492-201ENSMUST00000157192 297 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Gm25907-201ENSMUST00000158486 125 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Gm26404-201ENSMUST00000158498 109 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Gm17421-201ENSMUST00000167845 674 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Gm27161-201ENSMUST00000183960 562 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Gm28943-201ENSMUST00000186187 615 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Gm28736-201ENSMUST00000186257 615 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Gm29159-201ENSMUST00000187969 379 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Gm28780-201ENSMUST00000190223 615 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Gm29334-201ENSMUST00000190334 357 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Gm28969-211ENSMUST00000190992 615 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Gm28990-207ENSMUST00000191219 615 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Gm36468-201ENSMUST00000192119 615 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Gm31572-201ENSMUST00000193341 615 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Gm30858-201ENSMUST00000195516 615 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Gm43304-201ENSMUST00000196803 326 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Gm44109-201ENSMUST00000204514 1954 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Zfp813-ps-202ENSMUST00000204773 618 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Gm34885-201ENSMUST00000217440 4070 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 CT025606.1-201ENSMUST00000218273 324 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Gm18507-201ENSMUST00000218855 525 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 AC154598.1-201ENSMUST00000227079 347 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 AC161572.1-201ENSMUST00000227486 640 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Olfr474-201ENSMUST00000054434 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Mir504-201ENSMUST00000093602 79 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Olfr356-201ENSMUST00000095021 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd4P10628 Olfr1104-203ENSMUST00000215972 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 Zfhx4-205ENSMUST00000176383 13500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 Adam34-201ENSMUST00000110411 2584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 Gm43312-201ENSMUST00000201655 2466 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 AC112142.1-203ENSMUST00000228670 2472 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 Cyp3a11-201ENSMUST00000035918 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 Plcz1-201ENSMUST00000032356 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 Olfr364-ps1-202ENSMUST00000214905 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 Vmn1r1-203ENSMUST00000227629 3654 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 P2ry14-205ENSMUST00000197220 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 Gm26760-201ENSMUST00000181901 1604 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 Gm14325-203ENSMUST00000188914 1494 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 Mannr-201ENSMUST00000193549 1438 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 Gm44689-201ENSMUST00000208786 1372 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 Olfr1226-206ENSMUST00000217601 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 Eif3s6-ps1-201ENSMUST00000117907 470 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 n-R5s61-201ENSMUST00000122711 118 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 Gm15818-201ENSMUST00000134692 656 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 Gm22563-201ENSMUST00000157333 269 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 Gm8292-201ENSMUST00000162574 396 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 Gm9376-201ENSMUST00000171107 729 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 Vmn2r-ps116-201ENSMUST00000175997 126 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 Vmn2r-ps8-201ENSMUST00000177088 898 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 Gm21788-201ENSMUST00000177878 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 Gm28118-201ENSMUST00000185957 294 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 Gm43685-201ENSMUST00000198876 706 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 Gm17990-201ENSMUST00000211728 553 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd4P10628 CT010506.2-201ENSMUST00000225618 183 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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