Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm11673-201ENSMUST00000117846 331 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm14647-201ENSMUST00000119392 680 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm12564-201ENSMUST00000119860 321 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FxnO35943 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FxnO35943 4933406D12Rik-201ENSMUST00000147212 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FxnO35943 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FxnO35943 4930522O17Rik-201ENSMUST00000155178 447 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm25339-201ENSMUST00000157458 232 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm24060-201ENSMUST00000157494 95 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm24100-201ENSMUST00000178592 79 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FxnO35943 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm24137-201ENSMUST00000180055 79 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm22391-201ENSMUST00000180356 79 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm27653-201ENSMUST00000185037 136 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm28625-201ENSMUST00000188309 205 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm43968-201ENSMUST00000203388 389 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FxnO35943 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm44266-201ENSMUST00000205235 500 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm45814-201ENSMUST00000212646 775 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FxnO35943 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FxnO35943 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FxnO35943 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FxnO35943 Cldn34c4-201ENSMUST00000052500 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FxnO35943 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FxnO35943 Olfr251-201ENSMUST00000072731 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FxnO35943 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FxnO35943 Olfr1353-203ENSMUST00000205193 1924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FxnO35943 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FxnO35943 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FxnO35943 Pcsk2os2-201ENSMUST00000153878 3370 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FxnO35943 Olfr1313-203ENSMUST00000216071 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Ppef1-201ENSMUST00000071204 2483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm37652-201ENSMUST00000195290 2095 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Inpp4b-203ENSMUST00000109852 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Olfr1209-202ENSMUST00000213136 5611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Vmn1r-ps93-201ENSMUST00000117599 432 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Rps15a-ps8-201ENSMUST00000117914 387 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm11346-201ENSMUST00000118346 704 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm13064-201ENSMUST00000119125 557 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm12505-201ENSMUST00000146041 757 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm13775-201ENSMUST00000153865 751 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm24689-201ENSMUST00000157760 104 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Ranbp2-ps10-201ENSMUST00000185097 385 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm43150-201ENSMUST00000200931 636 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm5322-201ENSMUST00000206142 699 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 AC132384.5-201ENSMUST00000218562 226 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 AC156559.2-201ENSMUST00000224403 384 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 AC154788.1-201ENSMUST00000225003 340 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FxnO35943 AC107645.1-201ENSMUST00000228660 1810 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms