Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm28116-201ENSMUST00000189064 387 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 1700063I16Rik-201ENSMUST00000194611 611 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm9236-201ENSMUST00000196892 587 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm42622-201ENSMUST00000197229 355 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm43140-201ENSMUST00000197317 456 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 AC120011.1-201ENSMUST00000202147 744 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm45086-201ENSMUST00000209052 462 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 AC145736.1-201ENSMUST00000214661 479 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 AC154313.1-201ENSMUST00000217755 3841 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 AC138667.2-201ENSMUST00000224880 598 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 AC090496.1-201ENSMUST00000226020 260 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 AC154640.2-201ENSMUST00000226324 472 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm24031-201ENSMUST00000083930 131 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm10717-204ENSMUST00000099056 669 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm33680-202ENSMUST00000219411 3401 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 5930409G06Rik-201ENSMUST00000192347 1544 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 AC153969.1-201ENSMUST00000214047 2605 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm2824-202ENSMUST00000180955 3522 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm42728-201ENSMUST00000202644 1552 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm43185-201ENSMUST00000197507 2775 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm5615-201ENSMUST00000098900 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm37764-201ENSMUST00000194664 2150 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Zfp426-201ENSMUST00000080386 2417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm2396-202ENSMUST00000188232 3433 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 AC162910.1-201ENSMUST00000221219 1723 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 4921515E04Rik-202ENSMUST00000226383 1738 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm37363-201ENSMUST00000192336 2233 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm6367-201ENSMUST00000178646 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm14014-201ENSMUST00000156718 2717 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm36529-201ENSMUST00000222495 1529 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Trav8n-2-201ENSMUST00000103632 408 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm25096-201ENSMUST00000104043 129 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm23709-201ENSMUST00000104364 130 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Olfr483-201ENSMUST00000104917 1065 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm11219-201ENSMUST00000118565 358 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm11876-201ENSMUST00000120002 269 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm14655-201ENSMUST00000120124 578 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm2005-201ENSMUST00000120759 542 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm12971-201ENSMUST00000154720 511 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm25667-201ENSMUST00000157701 275 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 1700058P15Rik-201ENSMUST00000159981 413 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Reg3d-202ENSMUST00000167492 644 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm17421-201ENSMUST00000167845 674 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm3851-201ENSMUST00000168653 318 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm24315-201ENSMUST00000177835 127 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm5709-201ENSMUST00000177879 1165 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm14527-201ENSMUST00000179300 639 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm8649-201ENSMUST00000181799 233 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm27233-201ENSMUST00000184030 307 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm27551-201ENSMUST00000184258 77 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Rpl23a-ps8-201ENSMUST00000186144 463 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm20811-201ENSMUST00000190500 553 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Trbv12-3-201ENSMUST00000192675 372 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm38080-201ENSMUST00000194035 268 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm3010-201ENSMUST00000198805 448 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm42828-201ENSMUST00000199669 469 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm43975-201ENSMUST00000203023 481 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm18258-201ENSMUST00000210413 542 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Rps26-ps1-202ENSMUST00000212102 351 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 4930453C13Rik-201ENSMUST00000222376 765 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms