Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gm11913-201ENSMUST00000119094 336 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm13973-201ENSMUST00000121371 894 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm15533-201ENSMUST00000126205 465 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 4930405D11Rik-201ENSMUST00000132218 568 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Trim30e-ps1-202ENSMUST00000151294 731 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm25967-201ENSMUST00000157168 147 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm23602-201ENSMUST00000157258 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Mir3104-201ENSMUST00000174911 63 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Clec5a-204ENSMUST00000177178 665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Rpl36a-ps2-201ENSMUST00000197973 321 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm42567-201ENSMUST00000199268 352 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm44016-201ENSMUST00000203463 164 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm35876-201ENSMUST00000205044 459 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm8748-201ENSMUST00000211125 587 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm45814-201ENSMUST00000212646 775 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Olfr824-201ENSMUST00000074161 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Olfr1469-201ENSMUST00000077538 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Olfr267-202ENSMUST00000216719 4050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm38031-201ENSMUST00000191819 3015 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm14305-203ENSMUST00000108983 1497 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm2026-202ENSMUST00000109008 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm4724-202ENSMUST00000109046 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Fbxw28-201ENSMUST00000112039 1497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm14434-203ENSMUST00000122097 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm11007-202ENSMUST00000178120 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Olfr1231-202ENSMUST00000216144 3961 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Olfr17-202ENSMUST00000210568 3666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm17308-201ENSMUST00000181749 1997 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Nae1-201ENSMUST00000034349 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Olfr1019-202ENSMUST00000213515 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Fsip2-203ENSMUST00000143764 21116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Wfdc18-201ENSMUST00000001009 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm11406-201ENSMUST00000117418 484 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm9157-201ENSMUST00000117673 225 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Olfr1296-ps1-201ENSMUST00000117697 939 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm14352-201ENSMUST00000119250 449 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm15014-201ENSMUST00000120742 258 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm22501-201ENSMUST00000158981 127 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Olfr325-201ENSMUST00000169428 1065 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm21834-201ENSMUST00000178907 453 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm37495-201ENSMUST00000194590 264 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm38093-201ENSMUST00000195210 710 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm44993-201ENSMUST00000208435 842 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm45778-201ENSMUST00000211959 153 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 AC133498.1-203ENSMUST00000221213 668 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm7119-201ENSMUST00000221345 695 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm18388-201ENSMUST00000222339 557 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 4930453C13Rik-201ENSMUST00000222376 765 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 AC165366.1-201ENSMUST00000225905 505 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm4894-201ENSMUST00000067007 357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Prl2b1-201ENSMUST00000091678 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm40020-201ENSMUST00000215677 1635 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 5330434G04Rik-203ENSMUST00000142109 3449 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Vmn1r206-202ENSMUST00000227244 3970 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm38286-201ENSMUST00000195128 3105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm28465-202ENSMUST00000220779 1701 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Mc2r-201ENSMUST00000052347 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm14416-201ENSMUST00000118630 2308 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm15902-202ENSMUST00000219623 3477 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm12845-202ENSMUST00000204276 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Olfr105-ps-202ENSMUST00000215518 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Olfr1033-205ENSMUST00000218397 3973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Igkv7-33-201ENSMUST00000103376 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Ighv15-2-201ENSMUST00000103497 351 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Tcrg-C1-201ENSMUST00000103558 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Fam122c-201ENSMUST00000114835 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm15018-201ENSMUST00000117090 633 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm13167-201ENSMUST00000118554 578 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm14656-201ENSMUST00000120342 502 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm14926-201ENSMUST00000120650 508 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm16569-201ENSMUST00000160526 314 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm27033-201ENSMUST00000183226 544 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Mir6914-201ENSMUST00000184999 69 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm28141-201ENSMUST00000186676 342 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Ighv1-17-1-201ENSMUST00000194849 351 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm29704-201ENSMUST00000196011 253 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm9379-201ENSMUST00000196790 646 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm44355-201ENSMUST00000200417 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 4930587E11Rik-202ENSMUST00000204857 807 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Olfr490-202ENSMUST00000211345 1275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm3550W4VSN7 CT030247.1-201ENSMUST00000216810 267 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms