Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm2101-205ENSMUST00000156730 677 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm23542-201ENSMUST00000158208 96 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Obox4-ps35-201ENSMUST00000173825 680 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm23977-201ENSMUST00000177871 74 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm26430-201ENSMUST00000178054 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm11395-201ENSMUST00000181011 499 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm11394-201ENSMUST00000181421 517 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Mrgprc1-ps-201ENSMUST00000185552 952 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm21856-201ENSMUST00000187547 696 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm28408-201ENSMUST00000191557 463 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm44927-201ENSMUST00000207573 716 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 4930563J15Rik-203ENSMUST00000219796 574 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 CT025689.2-201ENSMUST00000224979 429 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 AC165366.1-201ENSMUST00000225905 505 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Olfr251-201ENSMUST00000072731 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm25141-201ENSMUST00000083177 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 n-R5s161-201ENSMUST00000083728 114 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm25410-201ENSMUST00000083758 137 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Olfr110-202ENSMUST00000216472 1721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Zfp119b-202ENSMUST00000189452 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Skint4-201ENSMUST00000069769 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm37244-201ENSMUST00000191748 1981 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm44751-201ENSMUST00000208302 4387 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Slco6d1-202ENSMUST00000160796 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm12509-201ENSMUST00000118033 609 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm13085-201ENSMUST00000118356 171 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Olfr343-ps1-201ENSMUST00000121883 303 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm23837-201ENSMUST00000122656 286 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Hba-ps4-201ENSMUST00000128900 447 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm14271-201ENSMUST00000137886 630 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm15521-201ENSMUST00000141752 835 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Rpl39-ps-202ENSMUST00000146505 151 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm12534-201ENSMUST00000147691 469 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm26489-201ENSMUST00000157880 264 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm24534-201ENSMUST00000157949 291 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Scarna6-201ENSMUST00000158656 265 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm27233-201ENSMUST00000184030 307 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm29228-201ENSMUST00000185489 418 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm5660-201ENSMUST00000197453 1149 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm43500-201ENSMUST00000201067 312 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Olfr1556-ps1-201ENSMUST00000204688 466 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 AC122332.1-201ENSMUST00000214384 285 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm30034-201ENSMUST00000219589 248 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 CT571268.1-201ENSMUST00000222320 407 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm44789-201ENSMUST00000207195 3101 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Il5ra-202ENSMUST00000204659 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Olfr357-202ENSMUST00000213218 5367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Sdr16c6-201ENSMUST00000095151 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Obox4-ps12-201ENSMUST00000180084 1362 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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