Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 4930570N18Rik-201ENSMUST00000159273 332 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ClpxQ9JHS4 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ClpxQ9JHS4 Gm17377-201ENSMUST00000165184 207 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ClpxQ9JHS4 Vmn1r-ps152-201ENSMUST00000176452 699 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ClpxQ9JHS4 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ClpxQ9JHS4 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
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ClpxQ9JHS4 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
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ClpxQ9JHS4 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
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ClpxQ9JHS4 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ClpxQ9JHS4 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
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ClpxQ9JHS4 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
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ClpxQ9JHS4 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
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ClpxQ9JHS4 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
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ClpxQ9JHS4 Olfr727-201ENSMUST00000079142 1035 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
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ClpxQ9JHS4 Gm10704-201ENSMUST00000098952 730 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ClpxQ9JHS4 Cyp3a25-201ENSMUST00000068317 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ClpxQ9JHS4 Olfr575-202ENSMUST00000213477 3512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ClpxQ9JHS4 Zfp708-201ENSMUST00000109742 2416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ClpxQ9JHS4 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ClpxQ9JHS4 Zfp426-201ENSMUST00000080386 2417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ClpxQ9JHS4 Olfr1226-207ENSMUST00000220416 3387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ClpxQ9JHS4 BC051076-202ENSMUST00000199477 2868 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ClpxQ9JHS4 Olfr1137-202ENSMUST00000214209 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ClpxQ9JHS4 Cwf19l2-201ENSMUST00000027027 4446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ClpxQ9JHS4 Olfr556-203ENSMUST00000217526 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ClpxQ9JHS4 Elavl4-206ENSMUST00000106601 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ClpxQ9JHS4 2310001H17Rik-203ENSMUST00000181517 3981 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
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