Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 1700010L04Rik-202ENSMUST00000178848 786 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Spin2e-201ENSMUST00000179716 705 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm8498-201ENSMUST00000188227 974 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm567-201ENSMUST00000197127 469 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm19418-201ENSMUST00000197436 580 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm44887-201ENSMUST00000208980 178 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 AC134468.2-201ENSMUST00000222549 672 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Cldn34c4-201ENSMUST00000052500 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Olfr209-201ENSMUST00000055868 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Mup21-201ENSMUST00000077719 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm6757-201ENSMUST00000189810 1706 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm12845-202ENSMUST00000204276 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Tex47-203ENSMUST00000160634 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 4932414N04Rik-201ENSMUST00000055930 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm5447-201ENSMUST00000070258 1773 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm23697-201ENSMUST00000103897 110 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm11372-201ENSMUST00000117348 570 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm11746-201ENSMUST00000119843 821 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm15263-201ENSMUST00000121556 642 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm11195-201ENSMUST00000135030 441 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm12971-201ENSMUST00000154720 511 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Slc9c1-201ENSMUST00000159945 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 R3hcc1l-202ENSMUST00000160107 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Cst12-202ENSMUST00000168443 546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps64-201ENSMUST00000173690 523 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm22120-201ENSMUST00000175590 70 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm20693-201ENSMUST00000177431 211 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm14527-201ENSMUST00000179300 639 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Otx2os1-201ENSMUST00000183522 866 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm37698-201ENSMUST00000192605 463 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm45034-201ENSMUST00000206831 482 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 AC153662.1-201ENSMUST00000222220 270 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 AC173481.1-201ENSMUST00000223351 270 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 AC170086.1-201ENSMUST00000225190 497 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 AC154467.1-201ENSMUST00000227527 449 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Olfr1046-201ENSMUST00000099902 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Olfr1009-203ENSMUST00000216443 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm43486-201ENSMUST00000196431 4339 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 C87414-206ENSMUST00000162964 2852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Olfr912-201ENSMUST00000217160 5726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Iigp1-201ENSMUST00000032473 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Olfr1226-204ENSMUST00000215987 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Olfr679-202ENSMUST00000214328 5184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Rab27b-203ENSMUST00000121693 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Olfr598-202ENSMUST00000214765 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Psmb7-ps2-201ENSMUST00000118546 820 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm22480-201ENSMUST00000122568 128 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Olfr1177-ps-201ENSMUST00000137895 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm13923-201ENSMUST00000153283 288 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm26362-201ENSMUST00000158865 315 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Mir713-201ENSMUST00000178651 108 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm21980-201ENSMUST00000180032 143 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Snhg5-202ENSMUST00000182232 781 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm29105-201ENSMUST00000187256 450 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm37431-201ENSMUST00000195102 111 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm5885-202ENSMUST00000203357 528 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm44583-201ENSMUST00000207478 281 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm45539-201ENSMUST00000210313 428 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 2210414F02Rik-201ENSMUST00000215316 396 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm35865-201ENSMUST00000220180 287 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm15421-201ENSMUST00000051985 443 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Olfr1148-201ENSMUST00000077580 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Olfr1490-201ENSMUST00000080162 951 ntAPPRIS P2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Cp-201ENSMUST00000003714 4092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm45264-201ENSMUST00000210090 3995 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Olfr744-203ENSMUST00000216690 1765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm43259-201ENSMUST00000198446 3277 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Ccr2-202ENSMUST00000165984 3515 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Olfr1446-203ENSMUST00000216805 2417 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Vmn1r22-202ENSMUST00000227650 3674 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm11939-201ENSMUST00000104931 300 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 S100a5-202ENSMUST00000107329 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm15120-201ENSMUST00000120602 301 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm3160-201ENSMUST00000128343 607 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm22531-201ENSMUST00000158819 140 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm22108-201ENSMUST00000177961 106 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm24798-201ENSMUST00000179334 106 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm26824-201ENSMUST00000180506 1164 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm29408-201ENSMUST00000187536 216 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 1700001D01Rik-201ENSMUST00000188654 565 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Mir129b-201ENSMUST00000197461 65 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm42470-201ENSMUST00000198086 251 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm40155-201ENSMUST00000198291 818 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm42567-201ENSMUST00000199268 352 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Olfr1498-ps1-201ENSMUST00000208721 991 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm18194-201ENSMUST00000210455 481 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Ccdc47Q9D024 Gm17989-201ENSMUST00000211543 412 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms