Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm28994-201ENSMUST00000188556 621 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm38363-202ENSMUST00000195029 622 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm19366-201ENSMUST00000206996 156 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 AC158686.2-201ENSMUST00000218599 976 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 D830005E20Rik-202ENSMUST00000219691 971 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 AC192616.3-201ENSMUST00000220797 1124 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 AC139750.2-201ENSMUST00000224424 386 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 AC154727.1-201ENSMUST00000226537 499 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 AC150560.2-201ENSMUST00000227208 171 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 AC154270.1-201ENSMUST00000227226 426 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm25403-201ENSMUST00000082971 143 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm23846-201ENSMUST00000083835 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 BB287469-201ENSMUST00000110149 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm4027-201ENSMUST00000164838 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 2610002M06Rik-201ENSMUST00000120722 5842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 AI314180-203ENSMUST00000107557 4946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 AC154548.1-201ENSMUST00000225844 3838 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm5248-201ENSMUST00000186108 4046 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm32647-201ENSMUST00000206116 3288 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm44860-201ENSMUST00000208473 2346 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm21119-201ENSMUST00000178438 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 AC160130.1-201ENSMUST00000220734 2735 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Vmn2r27-201ENSMUST00000100968 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 AC124446.1-201ENSMUST00000221027 2644 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm37412-201ENSMUST00000194866 4321 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm43065-201ENSMUST00000198971 2092 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm22115-201ENSMUST00000103976 133 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Usp38Q8BW70 Gm23923-201ENSMUST00000104108 133 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Usp38Q8BW70 Gm24608-201ENSMUST00000104381 136 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Usp38Q8BW70 Ctps2-203ENSMUST00000112300 741 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Usp38Q8BW70 Gm15988-201ENSMUST00000118677 367 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Usp38Q8BW70 Gm12103-201ENSMUST00000121892 362 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
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Usp38Q8BW70 Gm13618-201ENSMUST00000128859 384 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Usp38Q8BW70 Gm15218-201ENSMUST00000131006 618 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Usp38Q8BW70 Gm14246-201ENSMUST00000155173 680 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
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Usp38Q8BW70 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
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Usp38Q8BW70 1700012D16Rik-201ENSMUST00000197231 577 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Usp38Q8BW70 E330037G11Rik-201ENSMUST00000204295 1086 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
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Usp38Q8BW70 Olfr747-202ENSMUST00000205373 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
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Usp38Q8BW70 Gm45189-201ENSMUST00000208567 363 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
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Usp38Q8BW70 AC160972.1-201ENSMUST00000220971 644 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Usp38Q8BW70 AC136976.1-201ENSMUST00000221440 381 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
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Usp38Q8BW70 Olfr970-203ENSMUST00000215922 1739 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Usp38Q8BW70 Tenm1-203ENSMUST00000115059 12879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Usp38Q8BW70 Ccr9-205ENSMUST00000180093 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Usp38Q8BW70 Lipo5-201ENSMUST00000156818 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Usp38Q8BW70 Macf1-201ENSMUST00000082108 17331 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Usp38Q8BW70 Ckap5-204ENSMUST00000111338 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Usp38Q8BW70 Gprc6a-203ENSMUST00000219286 2574 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
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Usp38Q8BW70 Olfr823-202ENSMUST00000213145 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usp38Q8BW70 AC115034.1-201ENSMUST00000215393 3846 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usp38Q8BW70 AC156632.1-201ENSMUST00000220626 3845 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usp38Q8BW70 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usp38Q8BW70 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usp38Q8BW70 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usp38Q8BW70 Gm26418-201ENSMUST00000104275 137 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usp38Q8BW70 Gm17132-201ENSMUST00000109542 1158 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usp38Q8BW70 Vmn1r-ps108-201ENSMUST00000117059 365 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usp38Q8BW70 Gm12173-201ENSMUST00000117622 273 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usp38Q8BW70 Gm12697-201ENSMUST00000118008 667 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usp38Q8BW70 6030471H07Rik-201ENSMUST00000125884 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usp38Q8BW70 Gm22794-201ENSMUST00000157228 306 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usp38Q8BW70 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usp38Q8BW70 Nrg3os-201ENSMUST00000177141 927 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usp38Q8BW70 Gm23145-201ENSMUST00000178912 79 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usp38Q8BW70 Gm21773-201ENSMUST00000179355 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usp38Q8BW70 Gm21921-201ENSMUST00000180040 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usp38Q8BW70 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usp38Q8BW70 Gm28788-201ENSMUST00000189717 375 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usp38Q8BW70 Gm29558-201ENSMUST00000190134 375 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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