Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44300-201ENSMUST00000196792 121 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15927-204ENSMUST00000206075 372 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm34113-201ENSMUST00000213796 388 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 AL669916.5-201ENSMUST00000214874 361 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16381-201ENSMUST00000220528 503 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 AC154635.1-201ENSMUST00000221433 400 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 AC136976.1-201ENSMUST00000221440 381 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2001-201ENSMUST00000223236 503 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 AL645546.1-201ENSMUST00000225001 189 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl31-ps13-201ENSMUST00000060994 378 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr381-201ENSMUST00000078358 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26449-201ENSMUST00000082452 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26886-204ENSMUST00000181772 2085 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Vmn2r38-201ENSMUST00000108554 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Enam-202ENSMUST00000199104 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 A430106G13Rik-201ENSMUST00000182158 3388 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37498-201ENSMUST00000193524 4002 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29114-201ENSMUST00000187100 2508 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13972-201ENSMUST00000153726 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp992-201ENSMUST00000105733 4550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr1242-203ENSMUST00000143935 2406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr235-202ENSMUST00000207969 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 4932415D10Rik-202ENSMUST00000217661 15111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Jrkl-201ENSMUST00000110582 3223 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Tc2n-202ENSMUST00000160715 1386 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxw28-204ENSMUST00000200156 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr596-201ENSMUST00000104880 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13664-201ENSMUST00000117304 345 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15783-201ENSMUST00000117521 633 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13737-201ENSMUST00000119793 232 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Ifna-ps1-201ENSMUST00000119856 555 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Vmn1r-ps135-201ENSMUST00000120909 595 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Tarbp2-207ENSMUST00000142114 420 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15461-201ENSMUST00000143488 235 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16331-201ENSMUST00000144274 498 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 4930503B20Rik-203ENSMUST00000149825 970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm23084-201ENSMUST00000157850 114 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16563-201ENSMUST00000162673 423 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Vmn1r163-201ENSMUST00000164537 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Vmn1r135-201ENSMUST00000170931 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Fcf1-202ENSMUST00000171040 731 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20673-201ENSMUST00000177167 430 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Ighv6-5-201ENSMUST00000179796 297 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 1110015O18Rik-201ENSMUST00000183632 570 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Mir6393-201ENSMUST00000183709 94 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl23a-ps8-201ENSMUST00000186144 463 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Scgb2b28-ps-201ENSMUST00000188974 337 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37603-201ENSMUST00000192368 219 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43617-201ENSMUST00000196418 606 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10445-201ENSMUST00000203521 762 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm30717-201ENSMUST00000206549 494 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44681-201ENSMUST00000208447 842 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm34779-201ENSMUST00000210036 263 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 AC151843.1-201ENSMUST00000215960 691 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Slfn5os-202ENSMUST00000216469 550 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 AC160999.1-201ENSMUST00000225675 810 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
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H2-M10.4Q85ZW8 Defb4-201ENSMUST00000081017 454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
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H2-M10.4Q85ZW8 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr625-ps1-201ENSMUST00000098195 966 ntAPPRIS P5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Znf41-ps-201ENSMUST00000122051 2413 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38073-201ENSMUST00000195141 3665 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Tecrl-201ENSMUST00000053543 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem71-201ENSMUST00000048372 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6215-201ENSMUST00000119297 1386 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr728-202ENSMUST00000213685 7087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8734-201ENSMUST00000211669 1312 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Elf1-202ENSMUST00000110835 3888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25097-201ENSMUST00000104042 145 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Bsph2-201ENSMUST00000108526 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14142-201ENSMUST00000117833 296 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Sult1b1-203ENSMUST00000120150 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12587-201ENSMUST00000120180 427 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12755-201ENSMUST00000122297 282 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 n-R5s68-201ENSMUST00000122639 82 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr406-201ENSMUST00000133561 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11195-201ENSMUST00000135030 441 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13307-201ENSMUST00000141375 493 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm23540-201ENSMUST00000157543 164 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22840-201ENSMUST00000158444 136 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Serpina3l-ps-201ENSMUST00000163975 1264 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5929-201ENSMUST00000166883 487 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18354-201ENSMUST00000173515 1068 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Ap3m1-ps-201ENSMUST00000177652 1258 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 9330182O14Rik-201ENSMUST00000179120 423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21960-201ENSMUST00000181924 452 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37098-201ENSMUST00000192290 244 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms