Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17522-201ENSMUST00000178144 498 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21599-201ENSMUST00000178249 498 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21616-201ENSMUST00000178416 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21914-201ENSMUST00000178452 498 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17584-201ENSMUST00000178471 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17467-201ENSMUST00000178553 468 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21723-201ENSMUST00000178692 498 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21916-201ENSMUST00000178771 498 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21801-201ENSMUST00000178865 498 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21633-201ENSMUST00000178941 498 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17267-201ENSMUST00000178952 499 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17412-201ENSMUST00000179261 468 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24520-201ENSMUST00000179510 110 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21821-201ENSMUST00000179646 498 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17577-201ENSMUST00000179916 468 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21588-201ENSMUST00000180074 498 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21780-201ENSMUST00000180128 498 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21572-201ENSMUST00000180134 498 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21529-201ENSMUST00000180175 498 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29370-202ENSMUST00000187476 499 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv1-17-1-201ENSMUST00000194849 351 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc88cQ6VGS5 Gm35876-201ENSMUST00000205044 459 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18228-201ENSMUST00000217297 1091 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10242-201ENSMUST00000090064 330 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm28655-201ENSMUST00000191538 692 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr804-201ENSMUST00000077312 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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Ccdc88cQ6VGS5 Zfp352-201ENSMUST00000080541 1656 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr34-202ENSMUST00000096492 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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Ccdc88cQ6VGS5 n-R5s219-201ENSMUST00000104328 132 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15367-201ENSMUST00000122398 1016 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4222-201ENSMUST00000165784 470 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r-ps145-201ENSMUST00000175863 424 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25203-202ENSMUST00000200458 216 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc88cQ6VGS5 4930568D16Rik-201ENSMUST00000028243 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1031-201ENSMUST00000050942 1011 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25203-201ENSMUST00000082842 215 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1408-202ENSMUST00000200689 3453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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