Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Olfr1366-202ENSMUST00000175637 3045 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Ccdc73-201ENSMUST00000111114 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Olfr732-202ENSMUST00000213701 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Spag17-204ENSMUST00000164539 7862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm12374-201ENSMUST00000147108 3299 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Hdx-201ENSMUST00000038472 9385 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Olfr1123-203ENSMUST00000216208 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm5263-201ENSMUST00000163646 601 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps20-201ENSMUST00000176809 915 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm29259-201ENSMUST00000186396 694 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm4859-201ENSMUST00000199625 787 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm45513-201ENSMUST00000210228 376 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 CT009713.6-201ENSMUST00000223615 294 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Olfr1101-202ENSMUST00000214411 3235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Cfhr1-201ENSMUST00000023965 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 B830012L14Rik-201ENSMUST00000182785 4505 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Elavl4-206ENSMUST00000106601 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Tfpi-202ENSMUST00000090732 3576 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Zfp62-201ENSMUST00000061757 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Vmn1r90-207ENSMUST00000227692 7101 ntAPPRIS P2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Slfn8-203ENSMUST00000108152 3083 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Vmn1r185-202ENSMUST00000226694 5656 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Vmn1r71-207ENSMUST00000228248 5469 ntAPPRIS P2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm15190-201ENSMUST00000120855 276 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm13200-201ENSMUST00000138802 258 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Tarbp2-207ENSMUST00000142114 420 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm38093-201ENSMUST00000195210 710 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 AC134864.1-201ENSMUST00000226326 511 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Spink1-201ENSMUST00000025381 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Dnah7a-201ENSMUST00000094964 12245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Olfr476-202ENSMUST00000217173 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Plek-202ENSMUST00000102881 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Ccr2-201ENSMUST00000055918 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Olfr481-202ENSMUST00000213601 5247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Olfr876-203ENSMUST00000215287 4474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm14518-201ENSMUST00000117351 542 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm15142-201ENSMUST00000121013 856 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm7870-201ENSMUST00000184467 616 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm36985-201ENSMUST00000195595 379 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm5983-201ENSMUST00000197739 770 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Ighv1-68-201ENSMUST00000198789 294 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Klra7-202ENSMUST00000049304 1075 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Csn1s1-201ENSMUST00000094641 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Olfr681-201ENSMUST00000098157 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm37478-201ENSMUST00000193624 3495 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm2042-207ENSMUST00000181326 2440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Olfr657-203ENSMUST00000215454 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm43300-201ENSMUST00000198540 2043 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Olfr1226-206ENSMUST00000217601 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Mir3058-201ENSMUST00000175126 91 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm8220-203ENSMUST00000177877 381 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm5368-201ENSMUST00000189012 589 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm43574-201ENSMUST00000196226 809 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Cyp3a63-ps-201ENSMUST00000196626 1170 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm18672-201ENSMUST00000208035 270 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm18585-201ENSMUST00000215197 556 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Mbd3l1-203ENSMUST00000215255 708 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Olfr381-201ENSMUST00000078358 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Olfr192-201ENSMUST00000080251 925 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm23460-201ENSMUST00000083258 109 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Olfr1459-202ENSMUST00000213493 8854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Vmn1r71-205ENSMUST00000227940 4725 ntAPPRIS P2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm7452-202ENSMUST00000202891 3039 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Olfr709-ps1-202ENSMUST00000215468 5078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Olfr1454-203ENSMUST00000214695 4049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gpr34-201ENSMUST00000041708 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm37862-201ENSMUST00000193079 2533 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps106-201ENSMUST00000120587 824 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm15212-201ENSMUST00000122403 466 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm15671-201ENSMUST00000124160 576 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm13874-201ENSMUST00000130680 809 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm23121-201ENSMUST00000157653 173 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm23775-201ENSMUST00000158991 249 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Olfr1295-202ENSMUST00000207786 1043 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 AC152979.1-201ENSMUST00000218214 289 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Serpina7-201ENSMUST00000033626 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm38374-201ENSMUST00000194417 2033 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm10484-201ENSMUST00000196372 4759 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Olfr124-202ENSMUST00000215168 4497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Vmn1r184-202ENSMUST00000227230 7999 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm42996-201ENSMUST00000196116 1636 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm13664-201ENSMUST00000117304 345 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm11456-201ENSMUST00000121070 256 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm22849-201ENSMUST00000157713 307 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 AC154297.1-201ENSMUST00000171334 397 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms