Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Defb4-201ENSMUST00000081017 454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26064-201ENSMUST00000083381 109 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Ssxb3-202ENSMUST00000089379 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr583-201ENSMUST00000098211 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Fcrl5-203ENSMUST00000178261 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Fcrl5-201ENSMUST00000049926 1791 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp984-202ENSMUST00000122309 2405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Slc5a12-201ENSMUST00000045972 3529 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Spef2-206ENSMUST00000208854 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr364-ps1-202ENSMUST00000214905 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1348-207ENSMUST00000209029 2696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15752-201ENSMUST00000117427 394 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24251-201ENSMUST00000157324 114 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24931-201ENSMUST00000158324 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9613-201ENSMUST00000171662 196 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28595-201ENSMUST00000186223 437 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29634-201ENSMUST00000188467 696 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28699-201ENSMUST00000189193 696 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28181-201ENSMUST00000191460 687 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6162-201ENSMUST00000194870 2930 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm33973-201ENSMUST00000195148 534 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43142-201ENSMUST00000198670 361 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5034-201ENSMUST00000199115 634 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Igkv12-40-201ENSMUST00000199208 347 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2059-201ENSMUST00000212025 287 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 AC073947.3-201ENSMUST00000215576 766 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 AC164297.6-201ENSMUST00000224643 1568 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 CT030238.4-201ENSMUST00000228579 801 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr875-201ENSMUST00000080634 1004 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13084-201ENSMUST00000075045 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7269-201ENSMUST00000210819 1373 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr726-206ENSMUST00000217025 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr270-203ENSMUST00000215010 2502 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42843-201ENSMUST00000196328 3616 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 1700049E17Rik1-201ENSMUST00000095985 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 AC139754.3-201ENSMUST00000220444 1627 ntBASIC5.77□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4166-201ENSMUST00000220893 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm19619-201ENSMUST00000200707 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 AC163660.3-201ENSMUST00000224253 1563 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Akr1c14-202ENSMUST00000118717 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43654-201ENSMUST00000200664 3417 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11971-201ENSMUST00000117715 288 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 2610024D14Rik-201ENSMUST00000121233 294 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Tnfaip8-203ENSMUST00000126666 906 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21070-201ENSMUST00000182425 985 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 4930519F16Rik-206ENSMUST00000183292 800 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Mir6907-201ENSMUST00000183764 71 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17777-201ENSMUST00000189740 1276 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37202-201ENSMUST00000193679 361 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm19761-201ENSMUST00000205372 391 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45366-201ENSMUST00000209828 384 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 CT009713.9-201ENSMUST00000223604 389 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 AC168881.1-201ENSMUST00000226018 430 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr967-201ENSMUST00000069561 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44587-201ENSMUST00000207399 1685 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Chek1-205ENSMUST00000173963 1509 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1389-202ENSMUST00000216641 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 B230206I08Rik-201ENSMUST00000207479 3191 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr357-202ENSMUST00000213218 5367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45352-201ENSMUST00000210140 1452 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26535-201ENSMUST00000181602 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms