Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm18432-201ENSMUST00000195568 1451 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm15025-201ENSMUST00000118434 418 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm14915-201ENSMUST00000120747 204 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm4852-201ENSMUST00000121202 729 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm13775-201ENSMUST00000153865 751 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm15323-201ENSMUST00000156109 429 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm26153-201ENSMUST00000157433 127 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm21999-201ENSMUST00000165985 387 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm21094-201ENSMUST00000177842 498 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm20837-201ENSMUST00000178446 498 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm21739-201ENSMUST00000178639 498 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm28891-201ENSMUST00000178751 498 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm8247-202ENSMUST00000178759 375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm28490-201ENSMUST00000179076 498 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm21861-201ENSMUST00000179480 498 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm21256-201ENSMUST00000179672 498 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm20838-201ENSMUST00000179884 498 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm21679-201ENSMUST00000180373 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 RMST_1.1-201ENSMUST00000182623 407 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Mir6933-201ENSMUST00000184982 81 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm29332-201ENSMUST00000190829 227 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm44266-201ENSMUST00000205235 500 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Fxyd1-210ENSMUST00000206012 501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm23515-201ENSMUST00000082829 107 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm43266-201ENSMUST00000201049 1771 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 AC152414.1-201ENSMUST00000218784 2287 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Snhg14-214ENSMUST00000191191 3991 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 AC153494.1-201ENSMUST00000218664 3041 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm25096-201ENSMUST00000104043 129 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm5060-201ENSMUST00000120072 599 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm12691-201ENSMUST00000120186 456 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm14736-201ENSMUST00000121470 336 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm23534-201ENSMUST00000157539 97 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm7094-201ENSMUST00000178379 366 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm26871-205ENSMUST00000181926 742 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Ly6a-203ENSMUST00000187171 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Mrgprb1-202ENSMUST00000188095 472 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 4930443G03Rik-201ENSMUST00000203475 1282 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm7692-201ENSMUST00000213534 409 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 AC160016.1-201ENSMUST00000215589 448 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 AC153553.1-201ENSMUST00000218257 684 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 AC153141.1-201ENSMUST00000218636 501 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 AC125531.1-201ENSMUST00000219849 221 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 AL589742.1-201ENSMUST00000226034 349 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Olfr748-201ENSMUST00000073561 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm25008-201ENSMUST00000083809 81 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm29048-202ENSMUST00000190399 1601 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm3616-201ENSMUST00000174430 2514 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm3683-201ENSMUST00000175701 2513 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms