Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 AC155314.1-201ENSMUST00000227624 508 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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Gm28047Q3US59 4930522H14Rik-201ENSMUST00000082306 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28047Q3US59 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28047Q3US59 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28047Q3US59 4921539E11Rik-202ENSMUST00000097944 1683 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28047Q3US59 AC153532.3-201ENSMUST00000218660 3848 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28047Q3US59 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28047Q3US59 Olfr1271-202ENSMUST00000216383 6613 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28047Q3US59 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28047Q3US59 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28047Q3US59 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28047Q3US59 Abca16-202ENSMUST00000120490 5088 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28047Q3US59 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28047Q3US59 Gm43428-201ENSMUST00000200108 3845 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28047Q3US59 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28047Q3US59 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28047Q3US59 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28047Q3US59 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Gm28047Q3US59 Zfp184-205ENSMUST00000176511 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Gm28047Q3US59 Plcz1-201ENSMUST00000032356 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28047Q3US59 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Gm28047Q3US59 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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Gm28047Q3US59 Gm23205-201ENSMUST00000158671 103 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28047Q3US59 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Gm28047Q3US59 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28047Q3US59 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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Gm28047Q3US59 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Gm28047Q3US59 Evi2-202ENSMUST00000170422 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm28047Q3US59 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm28047Q3US59 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Gm28047Q3US59 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Gm28047Q3US59 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm28047Q3US59 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm28047Q3US59 Gm12039-201ENSMUST00000118219 180 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm28047Q3US59 Gm14731-201ENSMUST00000119216 376 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm28047Q3US59 Gm15113-201ENSMUST00000119280 836 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm28047Q3US59 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm28047Q3US59 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm28047Q3US59 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm28047Q3US59 Gm15212-201ENSMUST00000122403 466 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm28047Q3US59 Gm24371-201ENSMUST00000122662 267 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm28047Q3US59 Gm13470-201ENSMUST00000123911 421 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm28047Q3US59 Gm13348-201ENSMUST00000147324 690 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm28047Q3US59 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm28047Q3US59 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm28047Q3US59 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm28047Q3US59 Obox4-ps26-201ENSMUST00000176368 724 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm28047Q3US59 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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