Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm42992-201ENSMUST00000197043 6836 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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Znf48Q3US17 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 AC107645.1-201ENSMUST00000228660 1810 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Znf48Q3US17 Gm14434-201ENSMUST00000120521 559 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm25624-201ENSMUST00000157222 275 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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Znf48Q3US17 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Znf48Q3US17 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Znf48Q3US17 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Znf48Q3US17 AC124516.1-201ENSMUST00000221845 3544 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Znf48Q3US17 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Znf48Q3US17 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Znf48Q3US17 Svs2-201ENSMUST00000044953 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Znf48Q3US17 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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Znf48Q3US17 Gm6374-201ENSMUST00000159051 788 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Rpl30-ps2-201ENSMUST00000160070 291 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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Znf48Q3US17 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm20039-201ENSMUST00000210329 394 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 AC124729.1-201ENSMUST00000225327 976 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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