Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Ccnb2-ps-201ENSMUST00000118290 623 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm15951-201ENSMUST00000118377 400 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm15553-201ENSMUST00000118757 430 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Vps29-203ENSMUST00000118765 713 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm6584-201ENSMUST00000119671 447 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm12873-201ENSMUST00000119988 422 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm13555-201ENSMUST00000121668 319 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm14907-201ENSMUST00000121948 854 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm15038-201ENSMUST00000122144 296 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm26424-201ENSMUST00000122530 104 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm25177-201ENSMUST00000122634 117 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm13483-201ENSMUST00000123699 664 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Hba-ps4-201ENSMUST00000128900 447 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm23959-201ENSMUST00000157208 324 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm24503-201ENSMUST00000158454 135 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm22501-201ENSMUST00000158981 127 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 1700129C05Rik-204ENSMUST00000162674 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Mir8118-201ENSMUST00000183962 129 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 2810025M15Rik-203ENSMUST00000189791 251 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm29051-201ENSMUST00000190184 369 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm37495-201ENSMUST00000194590 264 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Igkv13-61-1-201ENSMUST00000198255 296 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 AU023762-202ENSMUST00000209716 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Olfr682-ps1-202ENSMUST00000214399 897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 AC069561.3-201ENSMUST00000217321 114 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 AC159380.1-201ENSMUST00000218096 121 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm2544-201ENSMUST00000222702 756 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 AC150560.2-201ENSMUST00000227208 171 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Vmn1r211-201ENSMUST00000073728 985 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Olfr381-201ENSMUST00000078358 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Tas2r110-201ENSMUST00000082014 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm43886-201ENSMUST00000205039 2386 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm30302-202ENSMUST00000220773 3511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 9330132A10Rik-201ENSMUST00000059118 3727 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 AC115034.1-201ENSMUST00000215393 3846 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 AC156632.1-201ENSMUST00000220626 3845 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 AL589737.1-201ENSMUST00000221163 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Olfr1082-201ENSMUST00000215600 1620 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Obscn-201ENSMUST00000020732 23483 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 2210418O10Rik-203ENSMUST00000136719 2314 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Lipo5-201ENSMUST00000156818 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm37626-201ENSMUST00000194332 4563 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm14385-201ENSMUST00000116315 876 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm12564-201ENSMUST00000119860 321 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm9003-201ENSMUST00000121810 482 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 4930597A21Rik-201ENSMUST00000128652 698 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Cyp3a25-202ENSMUST00000138870 513 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm9890-201ENSMUST00000171867 537 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm18354-201ENSMUST00000173515 1068 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm26933-201ENSMUST00000182320 827 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm38098-201ENSMUST00000194115 241 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm42896-201ENSMUST00000201249 1113 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm44134-201ENSMUST00000203064 661 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm32772-201ENSMUST00000205898 594 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm44946-201ENSMUST00000208425 572 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 AC115047.1-201ENSMUST00000213795 322 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Olfr178-203ENSMUST00000215032 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm7034-201ENSMUST00000218638 645 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 AC154727.1-201ENSMUST00000226537 499 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Klrc1-202ENSMUST00000032271 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Kap-201ENSMUST00000048032 707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Olfr1176-201ENSMUST00000057439 949 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Olfr1495-201ENSMUST00000061669 1089 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Rpl21-ps14-201ENSMUST00000080279 483 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Vmn1r171-203ENSMUST00000226321 3067 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm38278-201ENSMUST00000194715 1365 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm5127-201ENSMUST00000101296 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 AC140397.1-201ENSMUST00000225563 4562 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm37718-201ENSMUST00000191655 2631 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Csmd3-201ENSMUST00000100670 13022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Olfr970-203ENSMUST00000215922 1739 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Ifi208-202ENSMUST00000169857 1767 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Fscb-201ENSMUST00000059833 3361 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 AC124586.1-201ENSMUST00000221673 2795 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Lrp1b-201ENSMUST00000052550 16294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Trav10n-201ENSMUST00000103612 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm12173-201ENSMUST00000117622 273 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm14142-201ENSMUST00000117833 296 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm14903-201ENSMUST00000122435 537 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm11418-201ENSMUST00000156193 626 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm24898-201ENSMUST00000158133 106 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm26036-201ENSMUST00000158149 144 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm6395-201ENSMUST00000167639 691 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Pid1-206ENSMUST00000176822 1119 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Cox6b2-206ENSMUST00000182738 423 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm8296-201ENSMUST00000185597 524 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm28384-201ENSMUST00000189079 463 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm19774-201ENSMUST00000190667 114 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm38039-201ENSMUST00000195328 443 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Trim71Q1PSW8 Gm37291-201ENSMUST00000195637 533 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
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