Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm15142-201ENSMUST00000121013 856 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm11200-201ENSMUST00000121698 448 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 n-R5s174-201ENSMUST00000122638 121 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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ptchd1Q14B62 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm28785-201ENSMUST00000187478 379 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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ptchd1Q14B62 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 AC153977.1-201ENSMUST00000219416 506 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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ptchd1Q14B62 AC159621.1-201ENSMUST00000223249 163 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 AC115289.1-201ENSMUST00000224915 522 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 AC154239.1-201ENSMUST00000228565 406 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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ptchd1Q14B62 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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ptchd1Q14B62 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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ptchd1Q14B62 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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ptchd1Q14B62 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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ptchd1Q14B62 Evi2-202ENSMUST00000170422 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Drr1-202ENSMUST00000151575 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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ptchd1Q14B62 Gm23515-201ENSMUST00000082829 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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ptchd1Q14B62 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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ptchd1Q14B62 Nop58-215ENSMUST00000191142 9507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Vmn1r63-201ENSMUST00000075085 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Stag2-202ENSMUST00000115072 5955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Mga-201ENSMUST00000046717 11982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm44679-201ENSMUST00000207202 2908 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms