Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
VdrP48281 B3galt1-201ENSMUST00000042456 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
VdrP48281 Ccar1-201ENSMUST00000020268 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm5925-201ENSMUST00000105016 1497 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Vmn1r34-205ENSMUST00000227332 3075 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm5248-201ENSMUST00000186108 4046 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Herc2-202ENSMUST00000164095 15261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm22831-201ENSMUST00000102473 109 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm23837-201ENSMUST00000122656 286 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm16085-201ENSMUST00000144575 453 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm8221-201ENSMUST00000178052 564 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Rps19-ps12-201ENSMUST00000181937 430 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm27385-201ENSMUST00000184747 104 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm44076-201ENSMUST00000203072 520 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm44274-201ENSMUST00000203417 256 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm44041-201ENSMUST00000203678 396 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm17990-201ENSMUST00000211728 553 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 AC124826.1-201ENSMUST00000221651 325 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 S100a11-201ENSMUST00000029515 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Defb14-201ENSMUST00000052601 204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Olfr1012-203ENSMUST00000214958 3076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Adam28-201ENSMUST00000022642 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm37696-201ENSMUST00000194223 3349 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Olfr1226-207ENSMUST00000220416 3387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
VdrP48281 Slco1a5-201ENSMUST00000081380 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
VdrP48281 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
VdrP48281 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
VdrP48281 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
VdrP48281 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
VdrP48281 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
VdrP48281 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
VdrP48281 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
VdrP48281 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
VdrP48281 AC135119.1-201ENSMUST00000227935 3717 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
VdrP48281 Olfr1118-202ENSMUST00000216396 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
VdrP48281 Vmn1r173-202ENSMUST00000226233 9416 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm12789-202ENSMUST00000106915 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
VdrP48281 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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VdrP48281 Gm12110-201ENSMUST00000121601 579 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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VdrP48281 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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VdrP48281 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
VdrP48281 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
VdrP48281 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm42425-201ENSMUST00000197756 565 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm42990-201ENSMUST00000199231 312 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm44820-201ENSMUST00000207420 396 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm45455-202ENSMUST00000211156 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
VdrP48281 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
VdrP48281 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
VdrP48281 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
VdrP48281 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
VdrP48281 Olfr1313-203ENSMUST00000216071 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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