Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm13228-201ENSMUST00000118937 634 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm15733-201ENSMUST00000132957 242 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm16212-202ENSMUST00000143555 420 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm15597-201ENSMUST00000145924 1050 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 A630050E04Rik-201ENSMUST00000151443 581 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm22036-201ENSMUST00000157279 215 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm23228-201ENSMUST00000157296 270 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm3851-201ENSMUST00000168653 318 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm9613-201ENSMUST00000171662 196 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Nrg3os-201ENSMUST00000177141 927 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm20777-201ENSMUST00000177818 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm20834-201ENSMUST00000179558 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm20737-201ENSMUST00000179665 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm21310-201ENSMUST00000180130 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Snhg5-202ENSMUST00000182232 781 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm27648-201ENSMUST00000184315 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 1700067G17Rik-201ENSMUST00000186180 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm6712-202ENSMUST00000186431 526 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm29341-201ENSMUST00000190179 370 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm28060-201ENSMUST00000191554 189 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Ighv1-17-1-201ENSMUST00000194849 351 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Sult2a7-202ENSMUST00000209744 792 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Slfn5os-202ENSMUST00000216469 550 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 CAAA01216754.6-201ENSMUST00000217183 398 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm7530-201ENSMUST00000218466 605 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 AC140254.1-201ENSMUST00000220063 331 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm46369-201ENSMUST00000221577 401 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 AC144798.1-201ENSMUST00000228120 391 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr202-201ENSMUST00000049859 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr832-201ENSMUST00000060601 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr1013-201ENSMUST00000065626 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm4894-201ENSMUST00000067007 357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr1014-201ENSMUST00000076250 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm23443-201ENSMUST00000082916 128 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr681-201ENSMUST00000098157 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr679-201ENSMUST00000098158 952 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr592-203ENSMUST00000218618 5978 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Vmn1r56-201ENSMUST00000169556 1832 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr965-202ENSMUST00000213335 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm43736-201ENSMUST00000196377 2281 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm43268-201ENSMUST00000201536 4055 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm44527-202ENSMUST00000204519 1314 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm43883-201ENSMUST00000204002 3750 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr1079-203ENSMUST00000216480 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr1143-203ENSMUST00000111568 1970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Svs2-201ENSMUST00000044953 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr164-202ENSMUST00000216157 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Rpl23a-201ENSMUST00000102483 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm15951-201ENSMUST00000118377 400 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm14753-201ENSMUST00000118503 246 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm9308-201ENSMUST00000119073 448 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm13064-201ENSMUST00000119125 557 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm12252-201ENSMUST00000119517 219 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm12578-201ENSMUST00000121244 417 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm13852-201ENSMUST00000122350 242 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 AI847159-202ENSMUST00000138431 952 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm6058-201ENSMUST00000154261 399 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm16569-201ENSMUST00000160526 314 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Clec5a-204ENSMUST00000177178 665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm8247-202ENSMUST00000178759 375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Mir6914-201ENSMUST00000184999 69 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Mir6943-201ENSMUST00000185186 66 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm28935-201ENSMUST00000185737 568 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr1225-201ENSMUST00000188861 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm37340-201ENSMUST00000193124 759 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Csn1s2b-204ENSMUST00000197301 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm43814-201ENSMUST00000197851 413 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm3010-201ENSMUST00000198805 448 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm26691-203ENSMUST00000200444 479 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm7726-201ENSMUST00000206241 231 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 AC161520.1-201ENSMUST00000210954 939 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm18903-201ENSMUST00000215343 480 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 AC124399.1-201ENSMUST00000218334 590 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 AC153917.1-201ENSMUST00000218959 856 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm17829-201ENSMUST00000219782 344 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 AC133498.1-203ENSMUST00000221213 668 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Lrrc69-201ENSMUST00000023917 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Tsx-201ENSMUST00000033691 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Sult6b1-201ENSMUST00000042683 839 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm7099-201ENSMUST00000080066 554 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm24626-201ENSMUST00000082621 161 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm26064-201ENSMUST00000083381 109 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr392-201ENSMUST00000118463 3643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms