Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Olfr31-203ENSMUST00000217035 4126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Olfr1043-203ENSMUST00000213949 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm24429-201ENSMUST00000104076 132 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm24235-201ENSMUST00000104319 129 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Bsph2-201ENSMUST00000108526 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm15560-201ENSMUST00000117107 643 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm12693-201ENSMUST00000121965 483 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm22563-201ENSMUST00000157333 269 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm25348-201ENSMUST00000158961 111 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm3084-201ENSMUST00000169967 598 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm23864-201ENSMUST00000177607 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm21788-201ENSMUST00000177878 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 1700063H06Rik-201ENSMUST00000183678 445 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Mir7056-201ENSMUST00000183776 59 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm43941-201ENSMUST00000203303 1073 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm45004-201ENSMUST00000205302 465 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Olfr1341-201ENSMUST00000061215 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Olfr944-201ENSMUST00000079650 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Nr1h5-201ENSMUST00000058899 2835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Gm19113-201ENSMUST00000217552 1828 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Ighv3-1-201ENSMUST00000103478 350 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Ighv1-36-201ENSMUST00000103513 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Gm23578-201ENSMUST00000103943 104 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Gm25563-201ENSMUST00000104603 74 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps116-201ENSMUST00000175997 126 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Gm17467-201ENSMUST00000178553 468 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Gm17412-201ENSMUST00000179261 468 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Gm17577-201ENSMUST00000179916 468 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Gm27161-201ENSMUST00000183960 562 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Gm27660-201ENSMUST00000184028 208 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Gm33973-201ENSMUST00000195148 534 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Gm42750-201ENSMUST00000199745 353 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Gm17990-201ENSMUST00000211728 553 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Gm45731-201ENSMUST00000211988 1203 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Olfr586-201ENSMUST00000084811 954 ntAPPRIS P2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Adam39-201ENSMUST00000066814 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Gm3362-201ENSMUST00000148102 466 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Snrpe-203ENSMUST00000166291 360 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Gm22851-201ENSMUST00000178741 94 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Gm4854-201ENSMUST00000185902 574 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Gm5285-201ENSMUST00000193089 666 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Spocd1B1ASB6 Gm42542-201ENSMUST00000197978 268 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.3 ms