Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Spin2f-201ENSMUST00000177990 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Spin2e-201ENSMUST00000179716 705 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm21232-201ENSMUST00000182187 1006 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm28619-201ENSMUST00000185889 622 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm29405-201ENSMUST00000187204 370 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm28994-201ENSMUST00000188556 621 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 1700027A15Rik-203ENSMUST00000188793 423 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm7967-203ENSMUST00000191409 1049 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm38053-201ENSMUST00000193938 160 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm38363-202ENSMUST00000195029 622 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm36259-201ENSMUST00000197340 392 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm7468-201ENSMUST00000203900 652 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm44765-201ENSMUST00000206927 601 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm4501-201ENSMUST00000207330 551 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm4558-201ENSMUST00000207886 521 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm44543-201ENSMUST00000209136 396 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm46234-201ENSMUST00000218702 259 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 CT010444.1-201ENSMUST00000219963 3845 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Vmn1r36-202ENSMUST00000226635 918 ntAPPRIS P2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Krtap31-1-201ENSMUST00000093935 973 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm10356-201ENSMUST00000097152 1258 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm32061-201ENSMUST00000207232 3478 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm42728-201ENSMUST00000202644 1552 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Cfhr1-201ENSMUST00000023965 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Zfp72-202ENSMUST00000223163 4153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Vmn1r43-203ENSMUST00000226741 12542 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Zfp850-203ENSMUST00000180502 6163 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm29260-201ENSMUST00000186391 2759 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Ank2-208ENSMUST00000182078 14305 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Fbxw23-202ENSMUST00000198480 1388 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Trav12d-2-201ENSMUST00000103593 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Trav12n-2-201ENSMUST00000103619 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 2210407C18Rik-202ENSMUST00000108821 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Gm12636-201ENSMUST00000117395 624 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 9530034E10Rik-201ENSMUST00000146982 502 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 1700019E08Rik-202ENSMUST00000153567 635 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Gm25150-201ENSMUST00000157121 60 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Gm12002-203ENSMUST00000174550 923 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Gm21732-201ENSMUST00000179309 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Gm21773-201ENSMUST00000179355 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Gm21921-201ENSMUST00000180040 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Gm27254-201ENSMUST00000183926 517 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Gm27817-201ENSMUST00000184302 233 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Gm2617-201ENSMUST00000185690 1066 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Gm9775-201ENSMUST00000189402 331 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Gm37578-201ENSMUST00000192256 1177 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Igkv15-101-1-201ENSMUST00000196661 258 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Gm31693-201ENSMUST00000200150 909 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Igkv13-82-201ENSMUST00000200308 346 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Klk1b18-ps-201ENSMUST00000205780 167 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 AC134468.2-201ENSMUST00000222549 672 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 AC124433.2-201ENSMUST00000223867 291 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Kap-201ENSMUST00000048032 707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Olfr1018-201ENSMUST00000054201 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Olfr1124-201ENSMUST00000062494 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Vmn1r211-201ENSMUST00000073728 985 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Gm23448-201ENSMUST00000083151 104 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Gm43201-201ENSMUST00000195925 3416 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 9430018G01Rik-201ENSMUST00000203260 3758 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Vmn2r30-202ENSMUST00000174368 3688 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Gm45033-201ENSMUST00000206710 3167 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Slc22a30-203ENSMUST00000120540 2598 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Vmn1r66-201ENSMUST00000060374 1524 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 4930544M13Rik-202ENSMUST00000181553 1403 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Gm43882-201ENSMUST00000204871 2264 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Zfp930-201ENSMUST00000110216 1323 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Wdr49-203ENSMUST00000204341 1344 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Gm43200-201ENSMUST00000200385 2161 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Gm7739-201ENSMUST00000221131 1560 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Olfr145-202ENSMUST00000213688 6691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Gm23322-201ENSMUST00000104464 167 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Gm5757-201ENSMUST00000117494 528 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Gm14103-201ENSMUST00000119075 366 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Gm16100-201ENSMUST00000120489 231 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Gm22986-201ENSMUST00000122753 130 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Gm24905-201ENSMUST00000158129 104 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Gm18358-201ENSMUST00000173179 1277 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Gm25999-201ENSMUST00000175398 133 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Obox4-ps15-201ENSMUST00000178057 1140 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Obox4-ps19-201ENSMUST00000178284 1140 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Gm5473-201ENSMUST00000179326 642 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Obox4-ps20-201ENSMUST00000179591 1140 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Obox4-ps21-201ENSMUST00000179856 1140 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Cox6b2-206ENSMUST00000182738 423 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Gm27222-201ENSMUST00000183398 427 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Grik3B1AS29 Gm27190-201ENSMUST00000184890 542 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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