Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm36954-201ENSMUST00000195362 363 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm42458-201ENSMUST00000201914 369 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm22997-201ENSMUST00000082845 107 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 AC112142.1-203ENSMUST00000228670 2472 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm14305-202ENSMUST00000108981 1646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm37767-201ENSMUST00000193239 1834 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Olfr221-202ENSMUST00000214071 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Ppef1-201ENSMUST00000071204 2483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm23262-201ENSMUST00000158323 168 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Mrgprc1-ps-201ENSMUST00000185552 952 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 B130024G19Rik-205ENSMUST00000207952 485 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 AC153505.2-201ENSMUST00000217741 277 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 AC152979.1-201ENSMUST00000218214 289 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 CT025689.2-201ENSMUST00000224979 429 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Kap-201ENSMUST00000048032 707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm10139-201ENSMUST00000081471 171 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Olfr560-201ENSMUST00000210453 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Vmn2r-ps42-201ENSMUST00000174123 2083 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm13887-201ENSMUST00000119009 344 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Hmgb1-ps1-201ENSMUST00000119350 634 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Hmgb1-ps6-201ENSMUST00000119503 616 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm6062-201ENSMUST00000120462 631 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm11849-201ENSMUST00000121293 261 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm4761-201ENSMUST00000178086 582 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm27165-201ENSMUST00000183951 232 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 9130024F11Rik-203ENSMUST00000187858 447 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm29475-201ENSMUST00000190767 312 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm29192-201ENSMUST00000190942 377 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm37701-201ENSMUST00000192947 1100 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Olfr273-202ENSMUST00000107670 4796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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