Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm14333-201ENSMUST00000130484 264 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 2210408F21Rik-206ENSMUST00000138653 417 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 4933406D12Rik-201ENSMUST00000147212 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Ear-ps12-201ENSMUST00000161720 451 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm28781-201ENSMUST00000185760 696 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm4854-201ENSMUST00000185902 574 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm28255-201ENSMUST00000187101 694 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm29307-201ENSMUST00000187367 696 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm19641-201ENSMUST00000188432 417 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm29339-201ENSMUST00000189613 696 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm29407-201ENSMUST00000191468 696 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 4930443G03Rik-201ENSMUST00000203475 1282 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm44041-201ENSMUST00000203678 396 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm45857-201ENSMUST00000212207 356 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Olfr944-202ENSMUST00000213908 1257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 AC153917.1-201ENSMUST00000218959 856 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm18413-201ENSMUST00000221573 655 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Prl-203ENSMUST00000224228 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm23330-201ENSMUST00000082660 164 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Clec5a-202ENSMUST00000101491 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Olfr1263-202ENSMUST00000214382 4400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm42680-201ENSMUST00000196238 2500 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Acsm3-203ENSMUST00000106527 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm44144-201ENSMUST00000203683 1960 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm37527-201ENSMUST00000192406 3547 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 AC153494.1-201ENSMUST00000218664 3041 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm43882-201ENSMUST00000204871 2264 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Naalad2-207ENSMUST00000172171 4066 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Hmgb1-ps6-201ENSMUST00000119503 616 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm11200-201ENSMUST00000121698 448 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm11714-201ENSMUST00000136927 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm9006-201ENSMUST00000165520 841 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Obox3-ps5-201ENSMUST00000176412 1003 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-6-201ENSMUST00000193849 293 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm32447-201ENSMUST00000194265 697 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm44161-201ENSMUST00000203532 253 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 AC124826.1-201ENSMUST00000221651 325 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Tmed10-203ENSMUST00000222585 619 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 AL672194.1-201ENSMUST00000224841 603 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r50-201ENSMUST00000074943 2586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm4211-201ENSMUST00000181103 2220 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Mir147-201ENSMUST00000102354 79 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm24230-201ENSMUST00000104313 129 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm3669-203ENSMUST00000133259 677 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm14974-202ENSMUST00000150003 677 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm2165-204ENSMUST00000153493 677 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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