Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm24314-201ENSMUST00000158274 123 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm25977-201ENSMUST00000158697 85 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm6486-201ENSMUST00000166202 434 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm3851-201ENSMUST00000168653 318 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm9613-201ENSMUST00000171662 196 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Obox4-ps29-201ENSMUST00000175956 1134 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm28010-201ENSMUST00000179485 126 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm43765-201ENSMUST00000196303 893 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Olfr436-ps1-201ENSMUST00000203108 284 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm45006-201ENSMUST00000206078 690 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm44724-202ENSMUST00000208251 531 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Olfr840-ps1-201ENSMUST00000211827 917 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Olfr369-ps1-201ENSMUST00000212589 836 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Olfr194-202ENSMUST00000213228 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm46138-201ENSMUST00000215294 426 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 4930556N09Rik-202ENSMUST00000219466 1015 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 AC133101.1-201ENSMUST00000226939 1199 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Klra7-202ENSMUST00000049304 1075 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm24147-201ENSMUST00000082763 144 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Klra7-203ENSMUST00000088011 921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Olfr853-202ENSMUST00000213834 3888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Olfr1243-202ENSMUST00000144885 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm37345-201ENSMUST00000193062 3138 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Tecrl-201ENSMUST00000053543 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r80-204ENSMUST00000227471 6368 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Olfr1326-ps1-201ENSMUST00000059880 3637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Olfr290-202ENSMUST00000214501 5196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Olfr290-204ENSMUST00000216367 5182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r58-201ENSMUST00000108569 10140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Olfr1404-203ENSMUST00000217374 3686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm5347-201ENSMUST00000210542 2327 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 4930467E23Rik-201ENSMUST00000098909 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm42728-201ENSMUST00000202644 1552 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm5724-201ENSMUST00000148411 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Srek1-204ENSMUST00000210489 6330 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Rtl4-201ENSMUST00000096301 1758 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm15584-201ENSMUST00000123231 759 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm11195-201ENSMUST00000135030 441 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm7855-201ENSMUST00000137737 687 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Tarbp2-207ENSMUST00000142114 420 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Clec9a-203ENSMUST00000164513 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Obox2-202ENSMUST00000172478 818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm20399-201ENSMUST00000174652 132 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm20693-201ENSMUST00000177431 211 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm13698-201ENSMUST00000178325 732 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm13694-202ENSMUST00000178655 732 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm13696-201ENSMUST00000179311 732 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm13693-202ENSMUST00000179448 732 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm13695-202ENSMUST00000179504 732 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm13697-202ENSMUST00000179552 732 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm27952-201ENSMUST00000184748 105 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 2010005H15Rik-203ENSMUST00000187742 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm17916-203ENSMUST00000189918 324 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm29038-201ENSMUST00000191543 678 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm36934-201ENSMUST00000192007 306 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 2210017I01Rik-201ENSMUST00000195278 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm44349-201ENSMUST00000197048 123 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm2314-201ENSMUST00000200391 586 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm8774-201ENSMUST00000203621 692 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm19726-201ENSMUST00000205008 240 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Olfr593-202ENSMUST00000210686 951 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Olfr589-202ENSMUST00000218483 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 AC134468.2-201ENSMUST00000222549 672 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 AC138718.1-201ENSMUST00000225947 1009 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Olfr623-201ENSMUST00000068531 1075 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Mir133a-2-201ENSMUST00000083526 104 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Mir101b-201ENSMUST00000083622 97 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Erbin-207ENSMUST00000191275 5552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm43886-201ENSMUST00000205039 2386 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 AC126673.3-201ENSMUST00000223414 3829 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Olfr1012-202ENSMUST00000214255 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Olfr1079-203ENSMUST00000216480 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm3089-201ENSMUST00000200804 1395 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm3302-201ENSMUST00000201462 1395 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 4932415D10Rik-202ENSMUST00000217661 15111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Jrkl-201ENSMUST00000110582 3223 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm38065-201ENSMUST00000193147 3492 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Vmn2r90-201ENSMUST00000169805 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm24982-201ENSMUST00000104456 132 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Gm23322-201ENSMUST00000104464 167 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Gm3443-201ENSMUST00000112772 285 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Gm14907-201ENSMUST00000121948 854 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Gm15367-201ENSMUST00000122398 1016 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Sval2-201ENSMUST00000014248 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 4930503B20Rik-203ENSMUST00000149825 970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Gm24898-201ENSMUST00000158133 106 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Gm25898-201ENSMUST00000158303 106 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Gm18560-201ENSMUST00000173463 1123 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Ptma-ps1-201ENSMUST00000181079 309 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 1700067G17Rik-201ENSMUST00000186180 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Gm29341-201ENSMUST00000190179 370 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Gm37418-201ENSMUST00000195031 274 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.6 ms