Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm7588-201ENSMUST00000216866 571 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm28044-201ENSMUST00000044819 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1356-201ENSMUST00000061289 963 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Olfr850-201ENSMUST00000077347 948 ntAPPRIS P2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm24950-201ENSMUST00000082768 191 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm23971-201ENSMUST00000083317 191 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm23849-201ENSMUST00000083833 191 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm26316-201ENSMUST00000083886 191 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Rnu2-10-201ENSMUST00000084010 191 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Olfr172-201ENSMUST00000095991 1089 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb41-201ENSMUST00000039867 8361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 AC154462.1-201ENSMUST00000228897 2260 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Nlrp14-201ENSMUST00000084763 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Olfm3-201ENSMUST00000051309 3928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm37672-201ENSMUST00000192682 4014 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm15151-201ENSMUST00000117106 177 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm11488-201ENSMUST00000117277 863 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm13852-201ENSMUST00000122350 242 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm23905-201ENSMUST00000157568 109 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm20773-201ENSMUST00000178940 681 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm37088-201ENSMUST00000193887 406 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm4248-201ENSMUST00000196905 316 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm36520-201ENSMUST00000200449 400 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm43198-201ENSMUST00000200927 326 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm42758-201ENSMUST00000202146 283 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm19131-201ENSMUST00000203408 789 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm45189-201ENSMUST00000208567 363 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 AC153887.2-201ENSMUST00000219160 3838 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 AC090496.1-201ENSMUST00000226020 260 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Olfr294-201ENSMUST00000078588 1008 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Mir370-201ENSMUST00000083499 79 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 2310057J18Rik-202ENSMUST00000140558 1445 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm43871-201ENSMUST00000204931 1955 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Olfr918-202ENSMUST00000215461 3783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gabra2-203ENSMUST00000197284 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 4930473O22Rik-201ENSMUST00000218283 1465 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1293-ps-203ENSMUST00000217845 3628 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Olfr816-202ENSMUST00000213438 3306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Tug1-202ENSMUST00000144852 4720 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Olfr986-202ENSMUST00000214763 3274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Igkv3-7-201ENSMUST00000103399 299 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm23697-201ENSMUST00000103897 110 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm25726-201ENSMUST00000104529 129 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps93-201ENSMUST00000117599 432 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm11566-201ENSMUST00000118550 203 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm15364-201ENSMUST00000119618 585 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm27828-201ENSMUST00000184108 119 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm29598-201ENSMUST00000188996 588 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Sprr2g-202ENSMUST00000189634 651 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm18303-201ENSMUST00000190055 1176 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 1700024B18Rik-201ENSMUST00000190088 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Kcnmb2-206ENSMUST00000194796 338 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm43295-201ENSMUST00000201439 412 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm43415-201ENSMUST00000201934 750 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm8745-201ENSMUST00000207846 782 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm9375-201ENSMUST00000208899 903 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 AC166343.1-201ENSMUST00000213261 577 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm18016-201ENSMUST00000216119 801 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 AC125379.1-201ENSMUST00000221928 111 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 AC154241.1-201ENSMUST00000223952 356 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Prl3d3-202ENSMUST00000223958 675 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 AC139758.1-201ENSMUST00000226573 930 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 AC154738.1-201ENSMUST00000227054 368 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Sprr2g-201ENSMUST00000056590 650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r22-202ENSMUST00000227650 3674 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Olfr986-203ENSMUST00000216720 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 AC153801.2-201ENSMUST00000219875 3372 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r45-208ENSMUST00000228662 3309 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Olfr732-202ENSMUST00000213701 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm6215-201ENSMUST00000119297 1386 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Olfr392-202ENSMUST00000144724 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm45389-201ENSMUST00000211163 3399 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 AC153365.1-201ENSMUST00000219016 2031 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Mier1-201ENSMUST00000030247 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm336-201ENSMUST00000186376 1480 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Olfr187-202ENSMUST00000207673 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm5653-201ENSMUST00000223393 1337 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 A230004M16Rik-202ENSMUST00000139508 4468 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Pkhd1l1-202ENSMUST00000166957 12747 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Pkhd1l1-201ENSMUST00000038336 12741 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Mir761-201ENSMUST00000103245 76 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm24831-201ENSMUST00000116778 126 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm15313-201ENSMUST00000119179 282 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm11351-201ENSMUST00000139335 583 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm11337-201ENSMUST00000144770 335 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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