Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm44748-201ENSMUST00000206040 658 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 AC134864.1-201ENSMUST00000226326 511 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Cldn34c4-201ENSMUST00000052500 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Olfr623-201ENSMUST00000068531 1075 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm10916-201ENSMUST00000080330 483 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Mir202-201ENSMUST00000083568 72 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm22829-201ENSMUST00000083771 106 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Olfr1049-201ENSMUST00000099899 953 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Olfr735-202ENSMUST00000216634 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm26853-201ENSMUST00000180757 4010 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm45176-201ENSMUST00000207696 4096 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 AC124572.2-201ENSMUST00000218041 5152 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm38240-201ENSMUST00000195110 2487 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Cp-203ENSMUST00000108325 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Olfr875-202ENSMUST00000215128 2039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Olfr1440-208ENSMUST00000217062 7484 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Obox1-201ENSMUST00000067288 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 A230057D06Rik-203ENSMUST00000208953 3357 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 4930440C22Rik-201ENSMUST00000185490 1565 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm45854-201ENSMUST00000211857 3488 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Olr1-201ENSMUST00000032265 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm43376-202ENSMUST00000199747 1743 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 AI481877-201ENSMUST00000107547 4664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Sva-202ENSMUST00000117406 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm12458-201ENSMUST00000119387 495 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Cyp4b1-ps2-201ENSMUST00000119563 333 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm11623-201ENSMUST00000120176 1225 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Defa-ps5-201ENSMUST00000121541 279 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm24875-201ENSMUST00000158888 104 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Spink14-202ENSMUST00000162265 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm5929-201ENSMUST00000166883 487 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm10067-201ENSMUST00000179462 348 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm38214-201ENSMUST00000192581 988 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm37993-201ENSMUST00000195301 988 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm38154-201ENSMUST00000195444 340 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm43476-201ENSMUST00000197873 405 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm6639-204ENSMUST00000199182 800 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm45533-201ENSMUST00000210295 165 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Olfr1269-203ENSMUST00000216493 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm30198-201ENSMUST00000222873 824 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm33958-201ENSMUST00000222879 450 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 AC100733.1-201ENSMUST00000228494 407 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Olfr1052-201ENSMUST00000054746 940 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Olfr808-201ENSMUST00000060636 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Olfr745-201ENSMUST00000062534 1175 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Spp1-202ENSMUST00000086833 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm45804-201ENSMUST00000212137 3435 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm2824-202ENSMUST00000180955 3522 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm6902-202ENSMUST00000191169 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm43886-201ENSMUST00000205039 2386 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gda-202ENSMUST00000121725 2450 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Foxp2-203ENSMUST00000115470 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Vmn2r7-202ENSMUST00000161972 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm4736-201ENSMUST00000100870 380 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm25414-201ENSMUST00000101814 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm25097-201ENSMUST00000104042 145 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Apool-202ENSMUST00000113415 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Platr3-201ENSMUST00000146980 412 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm22817-201ENSMUST00000157448 356 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm22968-201ENSMUST00000157955 118 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm24675-201ENSMUST00000158757 259 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Olfr296-ps1-201ENSMUST00000173904 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm21425-201ENSMUST00000180318 699 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm27715-201ENSMUST00000184714 260 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm29522-201ENSMUST00000191530 621 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm4644-201ENSMUST00000197587 400 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Olfr566-202ENSMUST00000209952 1066 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm34005-201ENSMUST00000215834 282 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gstz1-204ENSMUST00000222222 724 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 AC139294.1-201ENSMUST00000226708 571 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Vmn1r89-206ENSMUST00000227319 985 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Olfr902-201ENSMUST00000050733 1056 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Olfr566-201ENSMUST00000071393 951 ntAPPRIS P2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Ccdc152-202ENSMUST00000226261 1327 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm12845-202ENSMUST00000204276 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm14308-203ENSMUST00000119149 1458 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm14434-202ENSMUST00000120959 1458 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 4921539E11Rik-202ENSMUST00000097944 1683 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 5830444F18Rik-201ENSMUST00000194009 1992 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Phex-201ENSMUST00000079945 6265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Olfr733-203ENSMUST00000214756 3640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 4921501E09Rik-201ENSMUST00000024121 3916 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Slfn10-ps-201ENSMUST00000100716 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm15304-201ENSMUST00000122150 2640 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Olfr1031-202ENSMUST00000216807 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Olfr787-202ENSMUST00000213329 4958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms