Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Spin2g-201ENSMUST00000178425 687 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Mir669a-7-201ENSMUST00000180364 87 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 4933440J02Rik-201ENSMUST00000181547 1144 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Cox6b2-208ENSMUST00000183971 401 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm28263-201ENSMUST00000185884 400 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm28967-201ENSMUST00000187351 281 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm37288-201ENSMUST00000193963 334 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm38039-201ENSMUST00000195328 443 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Mir669a-6-201ENSMUST00000196127 87 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm43617-201ENSMUST00000196418 606 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Mir669a-12-201ENSMUST00000197274 87 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Mir669a-5-201ENSMUST00000197439 87 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Mir669a-10-201ENSMUST00000197745 87 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Mir669a-11-201ENSMUST00000197952 87 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Amd-ps5-201ENSMUST00000198406 989 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Mir669a-4-201ENSMUST00000198665 87 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Mir669a-9-201ENSMUST00000200087 87 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Mir669a-8-201ENSMUST00000200268 87 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Igkv13-82-201ENSMUST00000200308 346 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm36520-201ENSMUST00000200449 400 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm43028-201ENSMUST00000202561 481 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm44032-201ENSMUST00000204841 166 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Spcs2-205ENSMUST00000207580 868 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Olfr1139-ps1-201ENSMUST00000217634 168 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 AC120383.1-201ENSMUST00000221123 573 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 AC122840.3-201ENSMUST00000221474 486 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 4930469K13Rik-202ENSMUST00000223852 537 ntAPPRIS P5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 AC130536.1-201ENSMUST00000224425 271 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Reg3g-201ENSMUST00000032089 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Tas2r124-201ENSMUST00000076150 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Olfr193-201ENSMUST00000076262 1009 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm23510-201ENSMUST00000083083 163 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Acsm3-203ENSMUST00000106527 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Csn3-203ENSMUST00000113271 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm43010-201ENSMUST00000195993 2878 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 AC123705.2-201ENSMUST00000221653 2009 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Olfr128-202ENSMUST00000216440 3644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Olfr1493-ps1-201ENSMUST00000207208 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm45223-201ENSMUST00000207037 5138 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Ncoa7-207ENSMUST00000215740 7043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gpm6a-201ENSMUST00000033915 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm37461-201ENSMUST00000193929 3704 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Vmn2r7-202ENSMUST00000161972 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Vmn1r184-204ENSMUST00000227534 4807 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Cyp3a25-201ENSMUST00000068317 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Dnah3-201ENSMUST00000046993 12252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm26140-201ENSMUST00000103807 110 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm22590-201ENSMUST00000104247 128 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Rpl35-ps1-201ENSMUST00000118070 372 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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Usp38Q8BW70 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 4930441J16Rik-201ENSMUST00000153743 516 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
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Usp38Q8BW70 Gm14419-204ENSMUST00000178182 192 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm2004-202ENSMUST00000178872 192 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
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Usp38Q8BW70 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 1700010J16Rik-202ENSMUST00000189116 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm45200-201ENSMUST00000207434 919 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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Usp38Q8BW70 Cdrt4-201ENSMUST00000035854 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Vmn1r211-201ENSMUST00000073728 985 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm11823-201ENSMUST00000130582 2278 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
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Usp38Q8BW70 Gda-202ENSMUST00000121725 2450 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm43374-201ENSMUST00000202498 2391 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Ghr-208ENSMUST00000161561 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Vmn1r171-203ENSMUST00000226321 3067 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Vmn2r77-201ENSMUST00000164996 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Mmrn1-201ENSMUST00000129603 4477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm44542-201ENSMUST00000208677 4314 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm45517-201ENSMUST00000209973 2468 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm15518-201ENSMUST00000127115 2108 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm18594-201ENSMUST00000175733 1403 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Kctd12b-202ENSMUST00000112572 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm14714-201ENSMUST00000119743 439 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm14600-201ENSMUST00000121032 630 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm23112-201ENSMUST00000158606 125 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm18604-201ENSMUST00000172535 558 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm20456-201ENSMUST00000174690 385 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm23215-201ENSMUST00000178153 121 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm20812-201ENSMUST00000179220 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 4933433F19Rik-201ENSMUST00000180571 1088 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm26983-201ENSMUST00000182051 388 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Mir6345-201ENSMUST00000184286 128 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 2900009J06Rik-201ENSMUST00000185310 498 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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