Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Gm13762-201ENSMUST00000144908 2612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Olfr362-202ENSMUST00000213817 4059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Polk-202ENSMUST00000091387 2382 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Evi2b-201ENSMUST00000179322 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Gm24190-201ENSMUST00000157976 216 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Rpl48-ps1-201ENSMUST00000177147 556 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Gm27893-201ENSMUST00000184408 194 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Gm16332-201ENSMUST00000134229 2967 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Olfr1224-ps1-206ENSMUST00000216976 2019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Ccdc152-202ENSMUST00000226261 1327 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Igkv3-7-201ENSMUST00000103399 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Bpifc-202ENSMUST00000105304 451 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 4930419G24Rik-201ENSMUST00000125494 1058 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Gm24537-201ENSMUST00000157950 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Gm44941-201ENSMUST00000204216 627 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Calml4-204ENSMUST00000214633 394 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Mbd3l1-203ENSMUST00000215255 708 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Olfr147-201ENSMUST00000056364 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Ckap5-204ENSMUST00000111338 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 AC126033.1-201ENSMUST00000227628 6773 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Olfr1263-202ENSMUST00000214382 4400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Postn-203ENSMUST00000107985 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Gm9696-201ENSMUST00000094227 3050 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Gm14014-201ENSMUST00000156718 2717 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Apool-202ENSMUST00000113415 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Gm15795-201ENSMUST00000160969 553 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Gm3123-201ENSMUST00000163480 480 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Gm20688-201ENSMUST00000176779 512 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Gm28954-201ENSMUST00000190031 437 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Gm31942-202ENSMUST00000195375 437 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Gm36173-201ENSMUST00000219101 1163 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Olfr677-201ENSMUST00000098161 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Vmn1r77-204ENSMUST00000228213 8094 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Vmn1r62-201ENSMUST00000173956 1757 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Gm37814-201ENSMUST00000195820 3644 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Gm24898-201ENSMUST00000158133 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Gm28924-201ENSMUST00000190012 241 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Gm20162-201ENSMUST00000193629 871 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Gm18672-201ENSMUST00000208035 270 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 AC134537.3-201ENSMUST00000220154 503 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 AC154552.2-201ENSMUST00000223117 794 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 2810403D21Rik-202ENSMUST00000124329 1660 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Cfh-206ENSMUST00000192880 3746 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Skint3-202ENSMUST00000170945 3843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Gm18913-201ENSMUST00000204311 1789 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Gm5368-201ENSMUST00000189012 589 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Tmed11-201ENSMUST00000004943 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Vmn1r43-201ENSMUST00000089418 1069 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Cngb3-201ENSMUST00000102999 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Gm6325-201ENSMUST00000122015 3114 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Gm13167-201ENSMUST00000118554 578 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Gm5943-201ENSMUST00000119458 459 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Gm23791-201ENSMUST00000122553 293 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Gm21980-201ENSMUST00000180032 143 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Scgb2b21-201ENSMUST00000185407 520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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Ttc28Q80XJ3 Gm42593-201ENSMUST00000198469 377 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Olfr1295-202ENSMUST00000207786 1043 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Ly6e-ps1-201ENSMUST00000222501 367 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Olfr138-203ENSMUST00000173841 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Stag2-201ENSMUST00000069619 5825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 CT010444.1-201ENSMUST00000219963 3845 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Vmn2r35-201ENSMUST00000169683 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Olfr1019-202ENSMUST00000213515 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Olfr1243-202ENSMUST00000144885 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 AY358078-201ENSMUST00000053821 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Scel-201ENSMUST00000095576 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
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Ttc28Q80XJ3 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Gm8392-201ENSMUST00000185647 835 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 4930402F11Rik-201ENSMUST00000207348 1000 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Calcrl-202ENSMUST00000099944 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Gm42996-201ENSMUST00000196116 1636 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 4932412D23Rik-203ENSMUST00000142270 4105 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ttc28Q80XJ3 Vmn1r71-205ENSMUST00000227940 4725 ntAPPRIS P2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
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