Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 2410024N13Rik-201ENSMUST00000090704 669 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm42486-201ENSMUST00000200369 3486 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Drr1-202ENSMUST00000151575 2789 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm43715-201ENSMUST00000196307 2715 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm13088-201ENSMUST00000105771 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Olfr1487-205ENSMUST00000217061 4080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Igkv5-48-201ENSMUST00000103364 360 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm20663-201ENSMUST00000176647 474 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 AC155929.1-201ENSMUST00000220217 1276 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 CT030704.1-201ENSMUST00000227521 699 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 B3galt1-202ENSMUST00000112346 4977 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Olfr365-202ENSMUST00000213969 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 AC124572.2-201ENSMUST00000218041 5152 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Olfr816-202ENSMUST00000213438 3306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm37930-201ENSMUST00000194308 1886 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Jpx-201ENSMUST00000181020 3802 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Mrgprx2-201ENSMUST00000098433 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Olfr1229-202ENSMUST00000213883 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 A630033H20Rik-205ENSMUST00000167673 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm15399-201ENSMUST00000118055 724 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Olfr1103-ps1-201ENSMUST00000119132 937 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm11746-201ENSMUST00000119843 821 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 1700071M16Rik-201ENSMUST00000164150 537 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm29484-201ENSMUST00000186067 324 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm29327-201ENSMUST00000188229 388 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm37575-201ENSMUST00000195467 309 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm9762-201ENSMUST00000036976 444 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm4017-201ENSMUST00000084813 338 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Atp1b4-201ENSMUST00000016471 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 AC124562.2-201ENSMUST00000223888 2313 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Serpinb3a-201ENSMUST00000027567 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Zfp955a-201ENSMUST00000008830 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Olfr633-202ENSMUST00000216006 3915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Polk-205ENSMUST00000221899 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm14681-201ENSMUST00000118047 411 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm6762-201ENSMUST00000121769 289 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm22034-201ENSMUST00000157283 134 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Vmn1r160-201ENSMUST00000171745 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 4930461G14Rik-201ENSMUST00000181967 843 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm17967-201ENSMUST00000195319 647 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Tshb-206ENSMUST00000200041 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm33981-201ENSMUST00000219918 660 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 4930519E07Rik-201ENSMUST00000200907 1665 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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NipblQ6KCD5 Olfr965-202ENSMUST00000213335 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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NipblQ6KCD5 1700010H22Rik-202ENSMUST00000187592 1003 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm37698-201ENSMUST00000192605 463 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Olfr972-201ENSMUST00000079767 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Vmn1r51-207ENSMUST00000227766 4218 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm37747-201ENSMUST00000193717 4003 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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NipblQ6KCD5 Prlr-205ENSMUST00000128921 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Nlrp4b-201ENSMUST00000047809 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
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NipblQ6KCD5 2810432F15Rik-201ENSMUST00000198632 657 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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NipblQ6KCD5 Gm44649-201ENSMUST00000205608 364 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Mir670hg-207ENSMUST00000211619 819 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Rps15a-ps1-201ENSMUST00000071120 393 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Olfr1085-203ENSMUST00000214566 5129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Mef2c-201ENSMUST00000005722 6217 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Olfr1020-202ENSMUST00000215347 2640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm20139-202ENSMUST00000216041 3888 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Olfr1331-202ENSMUST00000106360 3230 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Zfp62-212ENSMUST00000180016 3964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Olfr586-202ENSMUST00000211075 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Macc1-205ENSMUST00000222784 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm11576-201ENSMUST00000117433 417 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm14694-201ENSMUST00000121856 282 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm44844-201ENSMUST00000207242 336 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Gm22043-201ENSMUST00000082993 158 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NipblQ6KCD5 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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