Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7974-201ENSMUST00000117154 408 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6893-201ENSMUST00000118385 522 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8757-201ENSMUST00000119660 372 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16100-201ENSMUST00000120489 231 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13867-201ENSMUST00000120844 395 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2768-201ENSMUST00000121062 250 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 1700063H06Rik-201ENSMUST00000183678 445 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Mir496b-201ENSMUST00000184935 113 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Obox4-ps2-201ENSMUST00000185088 442 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29638-201ENSMUST00000186106 371 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 C530043A13Rik-201ENSMUST00000186453 550 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17929-201ENSMUST00000186851 627 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28389-201ENSMUST00000190090 697 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20811-201ENSMUST00000190500 553 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37119-201ENSMUST00000195691 389 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 1700024I08Rik-203ENSMUST00000222372 754 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1013-201ENSMUST00000065626 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr682-ps1-201ENSMUST00000071242 934 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr39-201ENSMUST00000071725 1098 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr850-201ENSMUST00000077347 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24031-201ENSMUST00000083930 131 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 AC131720.1-201ENSMUST00000218629 2132 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Slco1a1-201ENSMUST00000042119 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Lair1-201ENSMUST00000068865 6828 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11251-201ENSMUST00000119593 2800 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 AC133076.2-201ENSMUST00000227678 3532 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl35-ps1-201ENSMUST00000118070 372 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14793-201ENSMUST00000118739 311 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6373-201ENSMUST00000121026 360 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25290-201ENSMUST00000122796 144 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3084-201ENSMUST00000169967 598 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r-ps14-201ENSMUST00000176859 913 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22166-201ENSMUST00000178419 121 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23288-201ENSMUST00000179213 121 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28724-201ENSMUST00000186149 625 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43020-201ENSMUST00000197178 372 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45007-201ENSMUST00000206237 366 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44816-201ENSMUST00000206666 477 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 AC153924.1-201ENSMUST00000220117 312 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 AC174797.3-202ENSMUST00000224578 587 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 AC137961.1-201ENSMUST00000227924 734 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1022-201ENSMUST00000054736 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 H2al3-201ENSMUST00000057113 553 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr611-201ENSMUST00000078108 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42528-201ENSMUST00000200697 3418 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxl13-202ENSMUST00000115234 2143 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15128-202ENSMUST00000178833 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr495-202ENSMUST00000215215 2460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6757-201ENSMUST00000189810 1706 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38375-201ENSMUST00000194610 2227 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42955-201ENSMUST00000197355 3393 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14393-202ENSMUST00000109066 564 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r-ps135-201ENSMUST00000120909 595 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15517-201ENSMUST00000124863 251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14003-201ENSMUST00000130919 313 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25923-201ENSMUST00000158312 138 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17571-201ENSMUST00000167906 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27313-201ENSMUST00000183500 142 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Mir6238-201ENSMUST00000184140 129 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27414-201ENSMUST00000185033 381 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37803-201ENSMUST00000191620 711 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42539-201ENSMUST00000197009 308 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 2810432F15Rik-201ENSMUST00000198632 657 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44261-201ENSMUST00000203337 209 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr534-ps1-201ENSMUST00000211776 870 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45702-201ENSMUST00000211856 644 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8911-201ENSMUST00000213986 652 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 AC168059.1-201ENSMUST00000225846 841 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 AC140451.2-202ENSMUST00000226156 574 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r49-201ENSMUST00000071865 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.3 ms