Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 AC158142.1-201ENSMUST00000226721 416 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 AC158955.1-201ENSMUST00000227140 385 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Olfr881-201ENSMUST00000074611 948 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm23851-201ENSMUST00000083831 103 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Evi2-202ENSMUST00000170422 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 6820402A03Rik-201ENSMUST00000194648 2654 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Clec2g-203ENSMUST00000142388 2404 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Olfr59-201ENSMUST00000143976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Grik1-203ENSMUST00000114137 2894 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gabra6-202ENSMUST00000109286 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Pih1d3-201ENSMUST00000027230 1451 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm25418-201ENSMUST00000104214 129 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm13672-201ENSMUST00000117554 459 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm12237-201ENSMUST00000120158 470 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Olfr343-ps1-201ENSMUST00000121883 303 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm22725-201ENSMUST00000158092 110 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm6264-202ENSMUST00000162896 1217 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm37495-201ENSMUST00000194590 264 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm43710-201ENSMUST00000199583 452 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm29793-201ENSMUST00000202874 460 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Spata19-202ENSMUST00000214158 627 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm8942-201ENSMUST00000217892 400 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm17915-201ENSMUST00000222077 548 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 AC159621.1-201ENSMUST00000223249 163 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 AC154840.1-201ENSMUST00000225216 408 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 AC158142.2-201ENSMUST00000227892 635 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Fam26d-201ENSMUST00000048052 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Vmn1r63-201ENSMUST00000075085 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 2810428J06Rik-201ENSMUST00000198336 2696 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm26733-201ENSMUST00000180846 2046 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Zbbx-204ENSMUST00000107778 2467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 5730408A14Rik-201ENSMUST00000194955 1824 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Olfr51-202ENSMUST00000213415 2819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Rab9b-ps1-201ENSMUST00000119785 606 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm14591-201ENSMUST00000120407 518 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm6062-201ENSMUST00000120462 631 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm25665-201ENSMUST00000157695 110 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm23473-201ENSMUST00000158883 116 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm11168-202ENSMUST00000178077 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm5849-201ENSMUST00000180151 351 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Mir6382-201ENSMUST00000184055 110 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm34068-201ENSMUST00000193310 632 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm34838-201ENSMUST00000209231 958 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm39348-202ENSMUST00000217239 375 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm2446-201ENSMUST00000220144 772 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Mir19a-201ENSMUST00000083482 82 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 A530053G22Rik-201ENSMUST00000060147 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Macf1-204ENSMUST00000106213 18957 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp48Q3V0C5 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms