Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Obox4-ps12-201ENSMUST00000180084 1362 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Gm14706-201ENSMUST00000117744 255 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Hmgb1-ps1-201ENSMUST00000119350 634 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Gm13967-201ENSMUST00000120404 380 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Gm22433-201ENSMUST00000158550 142 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Gm3191-201ENSMUST00000167139 346 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Gm22114-201ENSMUST00000177756 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Gm29031-201ENSMUST00000185316 614 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Gm29000-201ENSMUST00000185444 614 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Gm28204-201ENSMUST00000185934 614 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Gm28290-201ENSMUST00000186505 614 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Gm28161-201ENSMUST00000186669 614 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Gm28255-201ENSMUST00000187101 694 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Gm28749-209ENSMUST00000189599 614 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Gm28872-201ENSMUST00000191518 158 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Gm33163-201ENSMUST00000194504 614 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 2210017I01Rik-201ENSMUST00000195278 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Gm43215-201ENSMUST00000199108 252 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Gm45367-201ENSMUST00000210171 347 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Ppef1-201ENSMUST00000071204 2483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Olfr560-201ENSMUST00000210453 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 AC154354.1-201ENSMUST00000224585 2109 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Znf48Q3US17 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Klra2-201ENSMUST00000032306 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm43527-201ENSMUST00000198749 3178 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Olfr1176-202ENSMUST00000213778 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Evi2-202ENSMUST00000170422 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Vmn2r107-201ENSMUST00000042090 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gnrh1-201ENSMUST00000111095 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm24586-201ENSMUST00000116695 89 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm12647-201ENSMUST00000118977 265 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm14926-201ENSMUST00000120650 508 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm14559-201ENSMUST00000121745 496 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Cst12-202ENSMUST00000168443 546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm8939-201ENSMUST00000192577 964 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm42500-201ENSMUST00000199898 517 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm44720-201ENSMUST00000206076 260 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 AC154472.2-201ENSMUST00000221186 288 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 AC174797.2-203ENSMUST00000224017 716 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm4987-201ENSMUST00000078326 408 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.6 ms