Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm14669-201ENSMUST00000118841 250 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm16566-201ENSMUST00000160387 910 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Rpl23a-ps8-201ENSMUST00000186144 463 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm18403-201ENSMUST00000192907 529 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm42812-201ENSMUST00000199844 337 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm40608-201ENSMUST00000213692 654 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Vmn2r-ps92-201ENSMUST00000220242 388 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm24763-201ENSMUST00000083688 190 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Olfr203-201ENSMUST00000089305 924 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm15975-201ENSMUST00000122385 1402 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm7237-201ENSMUST00000148435 1401 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm9077-201ENSMUST00000210657 2298 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gabra6-202ENSMUST00000109286 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm11912-201ENSMUST00000117235 264 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm6797-201ENSMUST00000119440 512 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Rab9b-ps1-201ENSMUST00000119785 606 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm14591-201ENSMUST00000120407 518 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm12422-201ENSMUST00000121431 302 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm15381-201ENSMUST00000121501 1156 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm12110-201ENSMUST00000121601 579 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm5699-201ENSMUST00000152491 723 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm20830-201ENSMUST00000178016 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm20812-201ENSMUST00000179220 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Mir7012-201ENSMUST00000183900 64 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm29045-201ENSMUST00000187278 698 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm17916-202ENSMUST00000187634 1187 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm8747-201ENSMUST00000195392 751 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm6510-201ENSMUST00000195916 574 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm44142-201ENSMUST00000203358 311 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm44718-201ENSMUST00000206886 359 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 AL669916.5-201ENSMUST00000214874 361 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 AC134537.2-201ENSMUST00000217770 575 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 AC123064.1-201ENSMUST00000218950 406 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm46996-201ENSMUST00000220924 408 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 AC158142.1-201ENSMUST00000226721 416 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Muc16-201ENSMUST00000034653 1035 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm24706-201ENSMUST00000082806 137 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm25008-201ENSMUST00000083809 81 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm23851-201ENSMUST00000083831 103 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm4017-201ENSMUST00000084813 338 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Prl2b1-201ENSMUST00000091678 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm37064-201ENSMUST00000193851 2231 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm42729-201ENSMUST00000201770 2930 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 AC154640.4-201ENSMUST00000226647 4640 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Mgat4c-202ENSMUST00000120748 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Olfr1443-201ENSMUST00000049724 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm15025-201ENSMUST00000118434 418 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms