Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 AC117656.3-202ENSMUST00000225842 1055 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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Sh3bp2Q06649 Gm22828-201ENSMUST00000083768 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Catsperg1-212ENSMUST00000169143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Lair1-203ENSMUST00000086401 2496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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Sh3bp2Q06649 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Olfr919-202ENSMUST00000215612 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Nae1-201ENSMUST00000034349 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Sh3bp2Q06649 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Sh3bp2Q06649 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Sh3bp2Q06649 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Sh3bp2Q06649 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm25156-201ENSMUST00000179809 79 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Sh3bp2Q06649 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Sh3bp2Q06649 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Sh3bp2Q06649 CT009754.1-201ENSMUST00000223489 558 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Sh3bp2Q06649 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Sh3bp2Q06649 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Sh3bp2Q06649 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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Sh3bp2Q06649 Gm11582-201ENSMUST00000121041 236 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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Sh3bp2Q06649 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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Sh3bp2Q06649 Obox4-ps6-201ENSMUST00000176578 724 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm18828-202ENSMUST00000181035 310 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm37272-201ENSMUST00000193401 488 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm43601-201ENSMUST00000196294 945 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 AC160124.1-201ENSMUST00000215539 519 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms