Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 1700013M08Rik-201ENSMUST00000197709 683 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VdrP48281 CT030254.2-201ENSMUST00000225902 502 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
VdrP48281 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VdrP48281 Defb7-201ENSMUST00000047851 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm7117-201ENSMUST00000071515 387 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VdrP48281 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm38010-201ENSMUST00000192592 2784 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VdrP48281 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
VdrP48281 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
VdrP48281 Entpd1-201ENSMUST00000112231 4221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
VdrP48281 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
VdrP48281 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm37781-201ENSMUST00000194773 3218 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VdrP48281 6720427I07Rik-201ENSMUST00000181490 2300 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 AC160130.1-201ENSMUST00000220734 2735 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm7308-201ENSMUST00000121087 447 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm14736-201ENSMUST00000121470 336 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm5123-201ENSMUST00000121905 837 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm11229-201ENSMUST00000121993 437 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm5755-201ENSMUST00000152394 837 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm24546-201ENSMUST00000158652 102 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm24757-201ENSMUST00000176987 371 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm26579-201ENSMUST00000181656 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Mir6971-201ENSMUST00000183497 63 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Mir6418-201ENSMUST00000185075 115 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 1700027A15Rik-202ENSMUST00000188349 617 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm44060-201ENSMUST00000204440 410 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm35876-201ENSMUST00000205044 459 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 AC122395.1-201ENSMUST00000214666 374 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm8158-201ENSMUST00000219220 465 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm8112-201ENSMUST00000219637 465 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Sult6b1-204ENSMUST00000169544 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm43374-201ENSMUST00000202498 2391 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Vmn1r39-203ENSMUST00000227285 2245 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Btbd35f7-201ENSMUST00000105007 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
VdrP48281 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
VdrP48281 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
VdrP48281 Casp12-201ENSMUST00000027009 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
VdrP48281 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
VdrP48281 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
VdrP48281 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
VdrP48281 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
VdrP48281 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm14681-201ENSMUST00000118047 411 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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VdrP48281 8030443G20Rik-201ENSMUST00000140919 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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VdrP48281 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm21070-201ENSMUST00000182425 985 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
VdrP48281 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
VdrP48281 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm28615-201ENSMUST00000187527 482 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm28700-201ENSMUST00000187614 579 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm37455-201ENSMUST00000191993 529 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm43645-201ENSMUST00000200129 341 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm43925-201ENSMUST00000203498 206 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
VdrP48281 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
VdrP48281 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
VdrP48281 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
VdrP48281 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
VdrP48281 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
VdrP48281 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
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