Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm12873-201ENSMUST00000119988 422 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm5384-201ENSMUST00000120313 463 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm15075-201ENSMUST00000122187 477 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm26476-201ENSMUST00000122618 313 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm22345-201ENSMUST00000122644 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr1177-ps-201ENSMUST00000137895 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 AI847159-204ENSMUST00000148997 753 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm11917-201ENSMUST00000154813 373 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm15323-201ENSMUST00000156109 429 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm24550-201ENSMUST00000158648 279 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm18604-201ENSMUST00000172535 558 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm20476-201ENSMUST00000172644 492 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm20619-202ENSMUST00000176283 1085 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Vmn2r-ps122-201ENSMUST00000176687 906 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm6625-201ENSMUST00000177870 272 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm27580-201ENSMUST00000183666 149 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm27315-201ENSMUST00000183977 154 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Scgb2b21-201ENSMUST00000185407 520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm29215-202ENSMUST00000188659 621 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm35070-201ENSMUST00000192589 621 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm30686-202ENSMUST00000195371 621 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm29815-201ENSMUST00000202418 178 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm35876-201ENSMUST00000205044 459 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm45209-201ENSMUST00000207122 353 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm45502-201ENSMUST00000209561 252 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm45814-201ENSMUST00000212646 775 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm35857-201ENSMUST00000212739 178 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm31717-201ENSMUST00000213044 668 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 CT030161.1-201ENSMUST00000218411 124 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 AC135019.1-201ENSMUST00000219949 307 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 LOC667541-201ENSMUST00000223408 278 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Kap-201ENSMUST00000048032 707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm25200-201ENSMUST00000083094 130 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm23455-201ENSMUST00000083331 100 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Ccl26-201ENSMUST00000094226 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr713-201ENSMUST00000098139 975 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Mageb5-201ENSMUST00000082048 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr1226-204ENSMUST00000215987 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm37777-201ENSMUST00000195546 3366 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Dst-211ENSMUST00000183034 23201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm12845-202ENSMUST00000204276 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Ccr3-201ENSMUST00000039171 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Vmn2r-ps100-201ENSMUST00000221238 1702 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Cp-201ENSMUST00000003714 4092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Igkv5-45-201ENSMUST00000103366 385 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr133-201ENSMUST00000113636 1090 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm12982-201ENSMUST00000117408 190 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm13268-201ENSMUST00000117485 433 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm12515-201ENSMUST00000120116 361 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Vmn1r-ps100-201ENSMUST00000120610 867 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm11645-201ENSMUST00000121589 649 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm10057-201ENSMUST00000144098 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm13595-201ENSMUST00000145994 494 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm22816-201ENSMUST00000157450 117 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm22726-201ENSMUST00000158089 179 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm22211-201ENSMUST00000158097 156 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm25436-201ENSMUST00000158275 145 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm25713-201ENSMUST00000158625 109 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm25971-201ENSMUST00000158953 286 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm22501-201ENSMUST00000158981 127 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Vmn1r-ps146-201ENSMUST00000176131 525 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm10067-201ENSMUST00000179462 348 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Mrgprb12-ps-201ENSMUST00000186150 949 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm29012-201ENSMUST00000187882 469 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Ralyl-205ENSMUST00000192209 662 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm7449-201ENSMUST00000194393 663 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm43559-201ENSMUST00000198755 466 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm2314-201ENSMUST00000200391 586 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm42850-201ENSMUST00000202094 201 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm8745-201ENSMUST00000207846 782 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm38944-201ENSMUST00000208218 512 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr1449-204ENSMUST00000215325 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm29884-201ENSMUST00000218403 453 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 AC158631.1-201ENSMUST00000219202 138 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 CT030242.2-201ENSMUST00000221588 148 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 AC138718.1-201ENSMUST00000225947 1009 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Lrrd1-201ENSMUST00000044039 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr1469-201ENSMUST00000077538 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm22304-201ENSMUST00000082688 129 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr338-202ENSMUST00000091006 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Ghr-208ENSMUST00000161561 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Cyp3a13-201ENSMUST00000031741 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm37204-201ENSMUST00000192389 3961 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Zfp711-201ENSMUST00000071814 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr183-202ENSMUST00000206303 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm18491-201ENSMUST00000192492 1594 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Zfp942-201ENSMUST00000074295 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Igkv1-135-201ENSMUST00000103303 394 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm22269-201ENSMUST00000104002 130 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 5033423K11Rik-201ENSMUST00000117311 787 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms