Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Vmn2r77-201ENSMUST00000164996 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm5155-201ENSMUST00000072381 2841 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Tcrg-C1-201ENSMUST00000103558 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Trav15-1-dv6-1-201ENSMUST00000103653 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Zfp389-201ENSMUST00000118425 675 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm13482-201ENSMUST00000119842 254 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Clec2f-201ENSMUST00000121051 374 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Vmn1r-ps3-201ENSMUST00000122439 917 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm22960-201ENSMUST00000122517 104 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm13274-202ENSMUST00000137624 271 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm12065-201ENSMUST00000149592 656 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm26354-201ENSMUST00000158221 129 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm26404-201ENSMUST00000158498 109 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm21815-201ENSMUST00000178213 664 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm23648-201ENSMUST00000180301 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm42850-201ENSMUST00000202094 201 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm43026-201ENSMUST00000202972 325 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 4930598N05Rik-201ENSMUST00000207048 550 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Olfr512-202ENSMUST00000209620 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 AC162931.1-201ENSMUST00000214184 267 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm35262-201ENSMUST00000215133 267 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 AC159380.1-201ENSMUST00000218096 121 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 AC154472.2-201ENSMUST00000221186 288 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 H2al3-201ENSMUST00000057113 553 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Olfr512-201ENSMUST00000074730 1056 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm23506-201ENSMUST00000083077 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Ube2v2-201ENSMUST00000096234 609 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 AC124586.1-201ENSMUST00000221673 2795 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm37363-201ENSMUST00000192336 2233 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm37781-201ENSMUST00000194773 3218 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Olfr1131-202ENSMUST00000213302 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm14125-201ENSMUST00000113442 680 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm15752-201ENSMUST00000117427 394 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm14706-201ENSMUST00000117744 255 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm14688-201ENSMUST00000119169 303 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm9498-201ENSMUST00000140849 291 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Grip1os2-201ENSMUST00000153898 722 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 4930519F16Rik-206ENSMUST00000183292 800 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm27599-201ENSMUST00000183758 174 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 1700128A07Rik-201ENSMUST00000186311 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 2810429I04Rik-209ENSMUST00000188642 674 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm29389-201ENSMUST00000191562 352 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm37492-201ENSMUST00000191948 376 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Olfr490-202ENSMUST00000211345 1275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Gm34113-201ENSMUST00000213796 388 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Olfr469-201ENSMUST00000075704 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Olfr972-201ENSMUST00000079767 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 mt-Nd4l-201ENSMUST00000084013 297 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Ceacam11-201ENSMUST00000094799 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Skint4-201ENSMUST00000069769 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Fbxw28-201ENSMUST00000112039 1497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 AC122317.3-201ENSMUST00000219320 3524 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpraP18052 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms