Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
P10404 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
P10404 Gm26430-201ENSMUST00000178054 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
P10404 Gm18828-202ENSMUST00000181035 310 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
P10404 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
P10404 Gm28781-201ENSMUST00000185760 696 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
P10404 Gm8600-201ENSMUST00000186320 905 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
P10404 Gm29307-201ENSMUST00000187367 696 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
P10404 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
P10404 Gm29339-201ENSMUST00000189613 696 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
P10404 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
P10404 Gm29407-201ENSMUST00000191468 696 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
P10404 Gm37503-201ENSMUST00000192088 319 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
P10404 Gm28724-202ENSMUST00000194218 295 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
P10404 Gm43975-201ENSMUST00000203023 481 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
P10404 Gm43968-201ENSMUST00000203388 389 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
P10404 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
P10404 Gm45368-202ENSMUST00000210944 416 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
P10404 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
P10404 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
P10404 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
P10404 AC158686.2-201ENSMUST00000218599 976 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
P10404 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
P10404 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
P10404 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
P10404 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
P10404 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
P10404 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
P10404 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
P10404 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
P10404 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
P10404 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
P10404 Gm42551-201ENSMUST00000197701 1573 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
P10404 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
P10404 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
P10404 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
P10404 Olfr235-206ENSMUST00000215407 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
P10404 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Olfr1173-201ENSMUST00000099830 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Olfr1355-201ENSMUST00000078414 3317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Gm11351-201ENSMUST00000139335 583 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Gm22290-201ENSMUST00000177655 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Gm22583-201ENSMUST00000178031 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Gm27699-201ENSMUST00000183553 180 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Gm27679-201ENSMUST00000184612 84 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Gm37746-201ENSMUST00000193249 198 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Gm8039-201ENSMUST00000204758 712 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Tmed10-203ENSMUST00000222585 619 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Olfr1369-ps1-201ENSMUST00000079050 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Gm37606-201ENSMUST00000191816 3116 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Clec2g-203ENSMUST00000142388 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Gm29488-201ENSMUST00000191427 2402 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Vmn1r57-202ENSMUST00000227798 2409 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Gm10647-201ENSMUST00000098612 2036 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Btbd35f23-201ENSMUST00000189190 1943 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
P10404 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
P10404 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
P10404 Vmn2r-ps56-201ENSMUST00000174814 2596 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
P10404 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
P10404 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
P10404 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
P10404 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
P10404 Gm37195-201ENSMUST00000192006 3018 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
P10404 Adgrv1-201ENSMUST00000095585 19338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
P10404 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
P10404 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
P10404 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms