Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Fgf7-202ENSMUST00000110442 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm42496-201ENSMUST00000197976 3241 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm6367-201ENSMUST00000178646 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Olfr1443-201ENSMUST00000049724 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Ms4a2-204ENSMUST00000186978 2391 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Plcb4-201ENSMUST00000035646 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm26156-201ENSMUST00000116999 123 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm11673-201ENSMUST00000117846 331 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm15231-201ENSMUST00000119174 447 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm15112-201ENSMUST00000120152 860 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm24784-201ENSMUST00000157640 62 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 4930556I23Rik-201ENSMUST00000160659 560 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm28943-201ENSMUST00000186187 615 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm28736-201ENSMUST00000186257 615 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm7858-201ENSMUST00000190177 622 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm28780-201ENSMUST00000190223 615 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm28969-211ENSMUST00000190992 615 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm28990-207ENSMUST00000191219 615 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm37455-201ENSMUST00000191993 529 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm36468-201ENSMUST00000192119 615 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm31572-201ENSMUST00000193341 615 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm37743-201ENSMUST00000194645 376 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm30858-201ENSMUST00000195516 615 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 CT030705.1-201ENSMUST00000223971 533 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Prl-203ENSMUST00000224228 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 AC098719.1-201ENSMUST00000228920 371 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm22740-201ENSMUST00000083439 109 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm3972-201ENSMUST00000173960 2861 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm43896-201ENSMUST00000203440 2032 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm43793-201ENSMUST00000201645 1333 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm28634-201ENSMUST00000191087 2613 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm20619-201ENSMUST00000175814 2008 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Igkv1-131-201ENSMUST00000103306 362 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm22021-201ENSMUST00000104353 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2035J3QP87 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms