Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 AC117237.1-201ENSMUST00000224035 395 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn34c3J3QJW5 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn34c3J3QJW5 Olfr168-201ENSMUST00000078554 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn34c3J3QJW5 Gm23939-201ENSMUST00000082880 133 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn34c3J3QJW5 Gm23506-201ENSMUST00000083077 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn34c3J3QJW5 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1167-201ENSMUST00000099832 1100 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn34c3J3QJW5 B130011K05Rik-201ENSMUST00000151765 3270 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn34c3J3QJW5 Adam34-201ENSMUST00000110411 2584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn34c3J3QJW5 Vmn2r21-201ENSMUST00000163607 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn34c3J3QJW5 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn34c3J3QJW5 B930086L07Rik-201ENSMUST00000209529 3738 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn34c3J3QJW5 Cast-208ENSMUST00000223033 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn34c3J3QJW5 Olfr235-206ENSMUST00000215407 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn34c3J3QJW5 Gm19335-201ENSMUST00000195836 2069 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn34c3J3QJW5 2810428J06Rik-201ENSMUST00000198336 2696 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1205-202ENSMUST00000215929 6149 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1387-202ENSMUST00000214541 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Cldn34c3J3QJW5 Gm7988-201ENSMUST00000196623 2297 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Cldn34c3J3QJW5 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Cldn34c3J3QJW5 Spc25-201ENSMUST00000005365 1352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Cldn34c3J3QJW5 AC115034.1-201ENSMUST00000215393 3846 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Cldn34c3J3QJW5 AC156632.1-201ENSMUST00000220626 3845 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Cldn34c3J3QJW5 Gm7903-201ENSMUST00000113172 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Cldn34c3J3QJW5 Gm5128-201ENSMUST00000113173 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Cldn34c3J3QJW5 Gm21037-201ENSMUST00000209086 2608 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Cldn34c3J3QJW5 B830012L14Rik-201ENSMUST00000182785 4505 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Cldn34c3J3QJW5 Nebl-206ENSMUST00000131957 1709 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Cldn34c3J3QJW5 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1258-203ENSMUST00000213720 7098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Cldn34c3J3QJW5 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Cldn34c3J3QJW5 Ccnb3-202ENSMUST00000115752 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Cldn34c3J3QJW5 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm25876-201ENSMUST00000104329 119 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Rps11-ps3-201ENSMUST00000117608 486 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm12564-201ENSMUST00000119860 321 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Hspe1-ps6-201ENSMUST00000120275 283 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm12755-201ENSMUST00000122297 282 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm25293-201ENSMUST00000122792 285 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm22236-201ENSMUST00000157093 106 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm23496-201ENSMUST00000157741 248 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Olfr325-201ENSMUST00000169428 1065 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 4933433F19Rik-201ENSMUST00000180571 1088 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm27919-201ENSMUST00000185163 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm28118-201ENSMUST00000185957 294 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm37636-201ENSMUST00000193583 359 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Rps27-206ENSMUST00000197361 329 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm43971-201ENSMUST00000205010 743 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Nasp-ps1-201ENSMUST00000205050 691 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm17737-201ENSMUST00000210183 1147 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Olfr593-202ENSMUST00000210686 951 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm45261-201ENSMUST00000211023 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm45727-201ENSMUST00000212886 572 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 AC154335.2-201ENSMUST00000225916 638 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 CT025525.4-201ENSMUST00000227728 277 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm7117-201ENSMUST00000071515 387 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Olfr881-201ENSMUST00000074611 948 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm25126-201ENSMUST00000083343 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Olfr593-201ENSMUST00000098206 984 ntAPPRIS P2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Abca5-201ENSMUST00000043961 8231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm20139-202ENSMUST00000216041 3888 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm9921-201ENSMUST00000173293 4399 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Srek1-204ENSMUST00000210489 6330 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm37323-201ENSMUST00000195771 2773 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gda-202ENSMUST00000121725 2450 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm30302-202ENSMUST00000220773 3511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Olfr824-202ENSMUST00000214192 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Macc1-205ENSMUST00000222784 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Cnot4-206ENSMUST00000202143 3202 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Ktn1-201ENSMUST00000022391 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm12845-202ENSMUST00000204276 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Ddi1-201ENSMUST00000051706 7114 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r169-202ENSMUST00000226669 2326 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Cyp3a11-201ENSMUST00000035918 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm44321-201ENSMUST00000204262 2855 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm44542-201ENSMUST00000208677 4314 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Igkv12-98-201ENSMUST00000103327 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm11673-201ENSMUST00000117846 331 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm14785-201ENSMUST00000120185 539 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms