Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Cngb3-201ENSMUST00000102999 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 AC104897.1-201ENSMUST00000222638 3628 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Gm13803-201ENSMUST00000117547 489 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Gm15142-201ENSMUST00000121013 856 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Gm8840-201ENSMUST00000122454 386 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Gm22034-201ENSMUST00000157283 134 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Gm24914-201ENSMUST00000157285 313 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Snord92-201ENSMUST00000175548 85 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Olfr908-201ENSMUST00000215139 932 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 5430401H09Rik-201ENSMUST00000218145 1076 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Fkbp1b-202ENSMUST00000219880 246 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 AC142499.1-201ENSMUST00000220036 374 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 AC107453.2-201ENSMUST00000227714 655 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Tsx-201ENSMUST00000033691 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Vmn1r89-201ENSMUST00000053008 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Gm813-201ENSMUST00000099663 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Rian-201ENSMUST00000180876 8089 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Gm44527-202ENSMUST00000204519 1314 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Vmn1r66-204ENSMUST00000228086 3013 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Olfr992-202ENSMUST00000213749 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Gm24936-201ENSMUST00000122598 247 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Gm12958-201ENSMUST00000141242 674 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Gm17218-201ENSMUST00000165911 410 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Gm37279-201ENSMUST00000194630 338 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Gm37587-202ENSMUST00000194935 475 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Gm5983-201ENSMUST00000197739 770 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Gm44995-201ENSMUST00000207056 504 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Olfr337-ps1-202ENSMUST00000213375 526 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Gm32281-202ENSMUST00000217220 691 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Gm6841-201ENSMUST00000220602 598 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Serpinb3d-201ENSMUST00000023861 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Gm37742-201ENSMUST00000193263 3979 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Zfp493-201ENSMUST00000164936 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Lyst-201ENSMUST00000110559 13181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Vmn1r47-202ENSMUST00000227229 6733 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Vmn1r47-204ENSMUST00000228680 6717 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Uty-205ENSMUST00000143286 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Gm12845-201ENSMUST00000203629 1767 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Olfr1318-201ENSMUST00000058176 1690 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Gm37158-201ENSMUST00000191652 5704 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Gm13155-201ENSMUST00000119277 646 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Gm8178-201ENSMUST00000121570 646 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Gm22310-201ENSMUST00000157509 116 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Gm37701-201ENSMUST00000192947 1100 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Gm44927-201ENSMUST00000207573 716 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 1700024I08Rik-203ENSMUST00000222372 754 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Gm40884-201ENSMUST00000223505 541 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Gm5347-201ENSMUST00000210542 2327 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 AC154634.4-201ENSMUST00000226077 2665 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usf3B2RUQ2 Olfr1500-204ENSMUST00000215760 2305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm42888-201ENSMUST00000202425 4361 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Trav16n-201ENSMUST00000103633 353 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm12805-201ENSMUST00000117305 1048 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm14581-201ENSMUST00000121726 198 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm4222-201ENSMUST00000165784 470 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm43155-201ENSMUST00000202661 494 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm18597-201ENSMUST00000209519 694 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm5917-201ENSMUST00000217638 721 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Olfr1033-202ENSMUST00000213865 3664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Olfr729-202ENSMUST00000213163 4283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Olfr959-202ENSMUST00000215194 4339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 AC156560.3-201ENSMUST00000222978 3841 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Tc2n-202ENSMUST00000160715 1386 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm7876-202ENSMUST00000171305 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Vmn1r22-202ENSMUST00000227650 3674 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Olfr364-ps1-203ENSMUST00000217298 2894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Trav14d-2-201ENSMUST00000103597 276 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Trav14n-2-201ENSMUST00000103623 276 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Traj31-201ENSMUST00000103710 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm26145-201ENSMUST00000104476 127 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm23530-201ENSMUST00000104564 137 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Bpifc-202ENSMUST00000105304 451 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm6274-201ENSMUST00000118173 797 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm13122-201ENSMUST00000118380 453 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm26215-201ENSMUST00000158584 139 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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