Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm13618-201ENSMUST00000128859 384 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm21814-201ENSMUST00000144085 291 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm25341-201ENSMUST00000157461 268 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm24940-201ENSMUST00000158326 108 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm21834-201ENSMUST00000178907 453 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm26960-201ENSMUST00000182263 412 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm19637-201ENSMUST00000185933 579 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm38053-201ENSMUST00000193938 160 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm44077-201ENSMUST00000203453 435 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm45252-201ENSMUST00000211579 397 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 AC133498.1-206ENSMUST00000223254 385 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 AC165092.2-201ENSMUST00000224681 368 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Sprr2i-201ENSMUST00000047264 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm10064-201ENSMUST00000071235 399 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Olfr199-202ENSMUST00000214186 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm15518-201ENSMUST00000127115 2108 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm14139-202ENSMUST00000109929 1485 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Platr25-202ENSMUST00000220733 2859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm38212-201ENSMUST00000194081 2756 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm13007-201ENSMUST00000121866 365 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm15212-201ENSMUST00000122403 466 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm14618-201ENSMUST00000149377 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm17183-201ENSMUST00000171170 493 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Obox4-ps6-201ENSMUST00000176578 724 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm28163-201ENSMUST00000187099 325 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Olfr944-201ENSMUST00000079650 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Vmn2r17-201ENSMUST00000171841 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Olfr360-202ENSMUST00000216706 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm13311-201ENSMUST00000117863 379 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm13681-201ENSMUST00000117925 210 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm15671-201ENSMUST00000124160 576 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm13173-201ENSMUST00000151703 441 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Scarna6-201ENSMUST00000158656 265 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
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