Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 4930503B20Rik-203ENSMUST00000149825 970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm16230-201ENSMUST00000155550 521 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm22059-201ENSMUST00000157544 104 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm7241-201ENSMUST00000159853 357 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Mir5098-201ENSMUST00000175320 82 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Prl8a8-201ENSMUST00000018389 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 1700067G17Rik-201ENSMUST00000186180 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm38045-201ENSMUST00000193536 199 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm37202-201ENSMUST00000193679 361 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 CAAA01216754.6-201ENSMUST00000217183 398 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 AC153568.1-201ENSMUST00000218165 341 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 AC122317.1-201ENSMUST00000218404 708 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm17829-201ENSMUST00000219782 344 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Tas2r139-201ENSMUST00000057686 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm23510-201ENSMUST00000083083 163 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Olfr774-201ENSMUST00000097164 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm14062-201ENSMUST00000134795 4134 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm12374-201ENSMUST00000147108 3299 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Clvs1-201ENSMUST00000038841 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm43793-201ENSMUST00000201645 1333 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Vmn1r172-201ENSMUST00000038694 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Vmn1r185-207ENSMUST00000227695 5292 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm5117-201ENSMUST00000178878 2553 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm44947-201ENSMUST00000208462 1981 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Olfr64-201ENSMUST00000081748 5001 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 6720489N17Rik-202ENSMUST00000201563 2640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm21033-201ENSMUST00000208590 2608 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm9343-201ENSMUST00000209016 2609 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Cd200r3-209ENSMUST00000166731 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Zfp131-202ENSMUST00000178271 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Vmn1r47-203ENSMUST00000227811 6792 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Olfr354-202ENSMUST00000217479 9539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Olfr810-204ENSMUST00000217283 4527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm26418-201ENSMUST00000104275 137 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Mir105-201ENSMUST00000104655 80 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Hspe1-ps6-201ENSMUST00000120275 283 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm12885-201ENSMUST00000122246 328 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 2310016D23Rik-201ENSMUST00000130082 388 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Vmn1r181-201ENSMUST00000181796 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm3434-202ENSMUST00000184421 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Sprr2g-202ENSMUST00000189634 651 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm28396-201ENSMUST00000190309 379 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm38279-201ENSMUST00000194067 1131 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 1110060G06Rik-201ENSMUST00000200372 499 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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Hdac9Q99N13 Gm7786-201ENSMUST00000210494 436 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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Hdac9Q99N13 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Sprr2g-201ENSMUST00000056590 650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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Hdac9Q99N13 Gm7381-201ENSMUST00000098958 300 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Cftr-203ENSMUST00000115406 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm43329-201ENSMUST00000200120 3232 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Olfr1185-ps1-201ENSMUST00000075025 3344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 4932411N23Rik-201ENSMUST00000081074 3407 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Nlrp4f-201ENSMUST00000037372 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Btbd35f7-201ENSMUST00000105007 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Olfr1082-201ENSMUST00000215600 1620 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Olfr616-203ENSMUST00000217293 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 2410141K09Rik-202ENSMUST00000172579 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 5330437M03Rik-201ENSMUST00000201318 4083 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm2004-201ENSMUST00000109049 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm14419-202ENSMUST00000126358 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm45378-201ENSMUST00000211063 2711 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm26019-201ENSMUST00000104407 119 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm13386-201ENSMUST00000117677 124 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm12760-201ENSMUST00000117861 482 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm11408-201ENSMUST00000117889 519 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Arl6-203ENSMUST00000118438 875 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm14554-201ENSMUST00000119548 661 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm14605-201ENSMUST00000120599 268 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Klra17-202ENSMUST00000122219 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm25572-201ENSMUST00000157527 172 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm15974-201ENSMUST00000159103 531 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Vmn1r163-201ENSMUST00000164537 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Vmn1r135-201ENSMUST00000170931 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm22120-201ENSMUST00000175590 70 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm17777-201ENSMUST00000189740 1276 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm44395-201ENSMUST00000197056 153 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Cycs-ps2-201ENSMUST00000197114 292 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hdac9Q99N13 Gm18429-201ENSMUST00000198707 421 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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