Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm12994-201ENSMUST00000119601 447 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Gm14725-201ENSMUST00000120324 828 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Gm16445-201ENSMUST00000120399 714 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Gm5646-201ENSMUST00000120568 714 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Llph-ps2-201ENSMUST00000122000 393 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Gm15022-201ENSMUST00000122074 746 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Gm12708-201ENSMUST00000126143 349 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Gm22312-201ENSMUST00000158005 130 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Gm8220-203ENSMUST00000177877 381 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Gm15143-201ENSMUST00000178180 714 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Mir6238-201ENSMUST00000184140 129 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Gm27805-201ENSMUST00000184513 79 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Gm27919-201ENSMUST00000185163 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Mrgprc1-ps-201ENSMUST00000185552 952 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Gm28847-201ENSMUST00000186778 700 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 1700027A15Rik-205ENSMUST00000191122 332 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Gm44133-201ENSMUST00000203823 701 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Olfr484-201ENSMUST00000210881 1098 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 AC153526.4-201ENSMUST00000217713 379 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 AC115735.3-201ENSMUST00000227757 513 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 AC144798.1-201ENSMUST00000228120 391 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Tshb-201ENSMUST00000029450 605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Olfr791-201ENSMUST00000057477 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Olfr986-201ENSMUST00000062229 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Cysltr1-201ENSMUST00000064892 1059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Gm2004-201ENSMUST00000109049 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Gm14419-202ENSMUST00000126358 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 9330159F19Rik-202ENSMUST00000213489 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Gm18954-201ENSMUST00000222200 1792 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Gm13084-201ENSMUST00000075045 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Vmn2r-ps43-201ENSMUST00000173798 2473 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Gm3665-201ENSMUST00000177214 2461 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Vmn2r-ps51-201ENSMUST00000177271 2461 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 4930510E17Rik-201ENSMUST00000034550 1639 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 AC131743.1-201ENSMUST00000222138 4024 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Gm281-201ENSMUST00000144914 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Cdh10-201ENSMUST00000040562 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Apobec3Q99J72 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm14293-201ENSMUST00000118528 577 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm12311-201ENSMUST00000118803 374 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm14067-201ENSMUST00000119340 314 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm11881-201ENSMUST00000119408 572 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm16100-201ENSMUST00000120489 231 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm23352-201ENSMUST00000158428 64 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 1700129C05Rik-204ENSMUST00000162674 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm3191-201ENSMUST00000167139 346 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm17571-201ENSMUST00000167906 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Mir5106-201ENSMUST00000174936 73 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Vmn1r-ps149-201ENSMUST00000176997 183 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm7438-201ENSMUST00000177664 639 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm7408-201ENSMUST00000178014 639 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm7386-201ENSMUST00000178020 639 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm3657-201ENSMUST00000178170 639 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm7415-201ENSMUST00000178205 639 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm7391-201ENSMUST00000178680 639 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm27875-201ENSMUST00000184425 123 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm37828-201ENSMUST00000192496 432 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm37223-202ENSMUST00000193592 490 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm33973-201ENSMUST00000195148 534 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm43586-201ENSMUST00000195948 310 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm43856-201ENSMUST00000197004 369 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm44002-201ENSMUST00000205134 594 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm45081-201ENSMUST00000206281 572 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm44543-201ENSMUST00000209136 396 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm18891-201ENSMUST00000216734 1087 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Olfr1324-203ENSMUST00000219631 1152 ntAPPRIS P2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 CT030170.6-201ENSMUST00000221149 550 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 AC154552.4-201ENSMUST00000222171 151 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 AC122393.1-201ENSMUST00000226570 319 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Olfr1324-201ENSMUST00000050044 1152 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Olfr339-201ENSMUST00000071437 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 n-R5s151-201ENSMUST00000083959 119 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms